La diferencia clave entre crRNA tracrRNA y gRNA es que crRNA es uno de los dos tipos de ARN de CRISPR, que es complementario a la secuencia de ADN objetivo, mientras que tracrRNA es el segundo tipo de ARN de CRISPR, que sirve como un andamio de unión para la nucleasa Cas y el ARNg es uno de los dos componentes principales del sistema CRISPR-Cas9 de bacterias y arqueas que reconoce el ADN objetivo y guía a las proteínas Cas para que rompan la doble hebra en el ADN objetivo.
CRISPR significa repeticiones palindrómicas cortas intercaladas regulares agrupadas. Es uno de los sistemas inmunes en bacterias y arqueas. Las bacterias y las arqueas utilizan este sistema para protegerse de los patógenos virales. Es uno de los mecanismos más sorprendentes que implica una modificación genética exitosa. Este mecanismo (CRISPR-Cas9) se utiliza como una nueva herramienta de edición de genes en biotecnología. Ha traído nuevos avances a la biotecnología, especialmente en el campo de la ingeniería genética.
Hay dos componentes principales del sistema CRISPR-Cas9. Son nucleasas de ARN guía (ARNg) y asociadas a CRISPR (Cas). El ARN guía es una secuencia de ARN específica que guía a las proteínas Cas para escindir el ADN objetivo. El ARN guía consta de dos tipos de ARN. Son el ARN crispr (ARNcr) y el ARNtracr. Las nucleasas asociadas a CRISPR (Cas) son endonucleasas no específicas que producen roturas de doble cadena en el ADN objetivo. Al hacer rupturas de doble cadena en el ADN objetivo, las bacterias y las arqueas dirigen sus mecanismos de reparación endógenos para inactivar el ADN viral.
¿Qué es el ARNcr?
crRNA o Crispr RNA es uno de los dos tipos de ARN guía. Estructuralmente, es una secuencia de 17-20 nucleótidos. La característica más valiosa de crRNA es que es complementario al ADN objetivo. Por lo tanto, crRNA coincide con la secuencia de ADN viral. La especificidad del sistema CRISPR-Cas 9 depende del crRNA. En las bacterias, el ARNcr existe fusionado con la secuencia del ARNtracr, que es el segundo tipo de ARN CRISPR. La producción de crRNA se desencadena por la reexposición de bacterias a un virus. Cuando se expone, tiene lugar la transcripción del gen que codifica el crRNA. Entonces, comienza el mecanismo de defensa contra el virus.
Figura 01: Sistema CRISPR-Cas9
¿Qué es tracrRNA?
Trans-activating crRNA o tracrRNA es la segunda parte de guideRNA o CRISPR RNA. Se pronuncia como ARN trazador. tracrRNA sirve como andamio de unión para la proteína endonucleasa Cas 9. En otras palabras, tracrRNA funciona como el mango para guiar a Cas9 hacia el ADN objetivo. Estructuralmente, tracrRNA tiene 42 nucleótidos. Existe combinado con crRNA.
¿Qué es el ARNg?
Guía de ARN o gRNA es uno de los dos componentes principales del sistema inmunitario CRISPR-Cas9. Es una secuencia específica de ARN compuesta por dos elementos: crRNA y tracrRNA. gRNA reconoce el ADN diana y dirige las proteínas Cas para hacer roturas de doble cadena en el ADN diana. Para hacerlo, el crRNA consta de una secuencia complementaria de ADN diana, mientras que el tracrRNA guía a las proteínas Cas a modo de mango.
Figura 02: ARNg
Diseñar el gRNA correcto es un paso crítico en la herramienta de edición de genes CRISPR-Cas9. Por lo tanto, el éxito y la eficiencia de edición del sistema CRISPR dependen de la secuencia correcta de gRNA. El ARNg se puede expresar en células a partir de un plásmido transfectado. Cuando los plásmidos clonados se introducen en las células, las células huésped generan ARNg. El gRNA generado con mayor frecuencia consta de 100 pares de bases.
¿Cuáles son las similitudes entre crRNA tracrRNA y gRNA?
- crRNA, tracrRNA y gRNA son secuencias de ARN que se encuentran en bacterias y arqueas.
- Todos pertenecen al sistema CRISPR.
- gRNA está hecho de crRNA y tracrRNA.
- Participan en el reconocimiento del ADN del bacteriófago y guían las endonucleasas hacia el ADN objetivo.
- Por lo tanto, los tres tipos de ARN están involucrados en la dirección de la nucleasa Cas9 para hacer rupturas de doble cadena en materiales genéticos extraños invasores.
- El éxito del experimento CRISPR depende de los tres tipos de ARN.
¿Cuál es la diferencia entre crRNA tracrRNA y gRNA?
crRNA es una parte de gRNA de CRISPR que es complementaria al ADN objetivo, mientras que tracrRNA es la segunda parte de gRNA, que sirve como andamio de unión para la nucleasa Cas.gRNA es la combinación de crRNA y tracrRNA, y es uno de los dos componentes del sistema CRISPR-Cas9, que reconoce el ADN objetivo y guía a las nucleasas para que rompan la doble hebra en el ADN objetivo. Entonces, esta es la diferencia clave entre crRNA tracrRNA y gRNA.
La siguiente tabla resume la diferencia entre crRNA tracrRNA y gRNA.
Resumen: crRNA frente a tracrRNA frente a gRNA
El sistema CRISPR-Cas9 es un sistema inmunitario de bacterias y arqueas. Este sistema se utiliza como herramienta de edición de genes en biotecnología. CRISPR consta de dos tipos de ARN, a saber, ARN CRISPR (ARNcr) y ARN CRISPR transactivador (ARNtracr). Se conocen colectivamente como guideRNA o gRNA. Este ARN reconoce las secuencias objetivo de los patógenos invasores y guía a las endonucleasas para que produzcan rupturas de doble cadena en el ADN objetivo. Una vez que se producen roturas de doble cadena en el material genético extraño, el mecanismo de reparación endógeno (unión de extremos no homólogos; NHEJ) inactiva el ADN extraño mediante la introducción de mutaciones. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre crRNA tracrRNA y gRNA.
