La diferencia clave entre CGH y CGH de matriz es que CGH es un método citogenético molecular tradicional para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más baja, mientras que CGH de matriz es un método citogenético molecular completamente automatizado para analizando la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más alta.
CGH y array CGH son dos técnicas para detectar variaciones en el número de copias en individuos. La variación del número de copias se refiere a las secciones del genoma que se repiten. El número de copias varía entre individuos. La variación del número de copias generalmente se clasifica en dos grupos: repeticiones cortas y repeticiones largas. Uno de los ejemplos más conocidos de una pequeña variación del número de copias es la repetición del trinucleótido CAG en el gen de la huntingtina. Esto provoca un trastorno neurológico llamado huntingtina. El mejor ejemplo de la variación del número de copias de repeticiones largas es el gen de la alfa amilasa, que provoca la resistencia a la insulina. La variación del número de copias se puede detectar mediante técnicas como FISH, CGH y array CGH.
¿Qué es CGH?
CGH es un método citogenético molecular tradicional para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba en comparación con una muestra de referencia. Tiene una resolución más baja en comparación con las técnicas automatizadas. El objetivo de esta técnica es comparar de manera rápida y eficiente dos muestras de ADN genómico que provienen de diferentes fuentes.
Figura 01: CGH
El procedimiento implica el aislamiento de ADN de dos fuentes: de prueba y de referencia. Luego, el siguiente paso es el etiquetado independiente de muestras de ADN de prueba y de referencia con fluoróforos de diferentes colores. Posteriormente, las dos muestras de ADN se desnaturalizaron para obtener las muestras de ADN monocatenario. Finalmente, se llevó a cabo la hibridación de las dos muestras de ADN resultantes en una proporción de 1:1 con una extensión de cromosomas en metafase normal. Las diferencias cromosómicas pueden identificarse entre las dos fuentes usando un microscopio de fluorescencia y software de computadora. Además, la técnica CGH solo es capaz de detectar anomalías cromosómicas desequilibradas.
¿Qué es Array CGH?
Array CGH es un método citogenético molecular completamente automatizado para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba en comparación con una muestra de referencia. Tiene una resolución más alta y fue desarrollado para minimizar las limitaciones del CGH tradicional. Array CGH combina los principios de CGH con el uso de microarrays. En lugar de utilizar la propagación de cromosomas en metafase, este método utiliza portaobjetos dispuestos con pequeños segmentos de ADN como objetivos. Estos microarreglos se realizaron depositando e inmovilizando una pequeña cantidad de ADN (sondas) sobre un soporte de vidrio sólido. El tamaño de las sondas puede variar desde un oligonucleótido hasta un cromosoma artificial bacteriano.
Figura 02: Matriz CGH
Independientemente de las sondas, el método básico de matriz CGH es similar a CGH. Una vez preparadas las sondas que contienen la micromatriz, las dos muestras de ADN (prueba y referencia) marcadas con fluoróforos de diferentes colores se mezclan y se añaden a la micromatriz. Dado que el ADN de las muestras es monocatenario debido a la desnaturalización, este ADN se hibrida con sondas monocatenarias ordenadas. Usando un sistema de imágenes digitales, es posible identificar las diferencias cromosómicas entre las dos fuentes.
¿Cuáles son las similitudes entre CGH y Array CGH?
- CGH y array CGH son dos técnicas para detectar variaciones en el número de copias.
- Son métodos de citogenética molecular.
- Ambos métodos diagnostican anomalías cromosómicas desequilibradas.
- Los fluoróforos están involucrados en ambos métodos.
- Ambos métodos se pueden utilizar para detectar trastornos genéticos debido a variaciones en el número de copias.
- Son ampliamente utilizados en el análisis genómico comparativo.
¿Cuál es la diferencia entre CGH y Array CGH?
CGH es un método citogenético molecular tradicional para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más baja, mientras que el array CGH es un método citogenético molecular totalmente automatizado para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más alta. Entonces, esta es la diferencia clave entre CGH y matriz CGH. Además, en CGH, las muestras de ADN de prueba y de referencia se hibridan con una metafase normal de cromosomas, pero en CGH de matriz, las muestras de ADN de prueba y de referencia se hibridan con las sondas de ADN inmovilizadas que contienen microarrays.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre CGH y CGH de matriz en forma tabular para compararlas lado a lado.
Resumen: CGH vs Array CGH
CGH y array CGH son dos técnicas citogenéticas moleculares para detectar anomalías cromosómicas desequilibradas. Son ampliamente utilizados en el análisis genómico comparativo. CGH es un método citogenético molecular tradicional para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más baja. Por el contrario, array CGH es un método citogenético molecular completamente automatizado para analizar la variación del número de copias en el ADN de una muestra de prueba que tiene una resolución más alta. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre CGH y matriz CGH.
