La diferencia clave entre NGS y WGS es que la secuenciación de próxima generación (NGS) es una tecnología de secuenciación masivamente paralela de segunda generación que es de alto rendimiento, bajo costo y rápida, mientras que la secuenciación del genoma completo (WGS) es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula en un solo momento mediante el uso de técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento.
En las últimas décadas, la comprensión del genoma de los humanos y otros animales ha aumentado enormemente debido al descubrimiento de técnicas de secuenciación rápida y herramientas bioinformáticas. Las técnicas de secuenciación convencionales, como la secuenciación de Sanger, tenían sus limitaciones, lo que requería el desarrollo de nuevos métodos de secuenciación rápida, como la secuenciación de próxima generación (NGS) y la secuenciación de nanoporos. La técnica de secuenciación del genoma completo (WGS) es un enfoque reciente que ya se utiliza en muchos proyectos de investigación genómica, como el proyecto 100 000 genomic de Genomic England, Reino Unido. Entonces, NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que se están incorporando actualmente en muchos proyectos genómicos.
¿Qué es NGS?
NGS (secuenciación de próxima generación) es una tecnología de secuenciación masivamente paralela de segunda generación que es de alto rendimiento, bajo costo y rápida. No existe una definición precisa para la secuenciación de próxima generación. Pero podemos distinguirlo claramente de las técnicas convencionales de secuenciación capilar. La secuenciación de próxima generación permite la secuenciación de una molécula de ADN con un tamaño total superior a 1 millón de pares de bases en un solo experimento. Ofrece una velocidad sin precedentes y opciones de alto rendimiento, como permitir la secuenciación del ADN de varias personas al mismo tiempo. Esto se logra miniaturizando el volumen de las reacciones de secuenciación individuales. Además, esto también limita el tamaño de los instrumentos y minimiza el costo de los reactivos por reacción.
Figura 01: Plataformas NGS
NGS es un método de secuenciación de lectura corta que ya ha revolucionado el campo de la investigación biológica. Además, la NGS se aplica en diversas áreas, como la secuenciación del genoma de novo, la secuenciación del genoma completo, el análisis de transcriptomas, la secuenciación de ARN pequeño y microARN, la resecuenciación dirigida y la secuenciación del exoma completo.
¿Qué es WGS?
WGS (secuenciación del genoma completo) es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula en un solo momento mediante el uso de técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento. También se conoce como secuenciación completa del genoma o secuenciación completa del genoma. La secuenciación del genoma completo implica la secuenciación de todo el ADN cromosómico de un organismo, así como el ADN en las mitocondrias, y para las plantas, el ADN en el cloroplasto en un solo momento. WGS permite a los científicos leer la secuencia exacta de todas las letras que componen el conjunto completo de ADN. Se espera que la WGS que utiliza la plataforma NGS revolucione la configuración clínica.
Figura 02: WGS frente a secuenciación de escopeta jerárquica
La secuenciación del genoma completo se introdujo en la atención clínica en 2014. Además, la aplicación de WGS implica la secuenciación de genes a nivel de SNP para identificar variantes funcionales en estudios de asociación, intervención terapéutica en medicina personalizada, biología evolutiva, análisis genómico comparativo, estudios de mutaciones y reordenamientos, estudios de asociación de variantes raras y predicción de susceptibilidad a enfermedades y respuesta a fármacos.
¿Cuáles son las similitudes entre NGS y WGS?
- NGS y WGS son dos técnicas de secuenciación.
- Ambas técnicas secuencian ADN o ARN.
- Estas técnicas son nuevas y confiables.
- Ambos se utilizan para diagnosticar enfermedades y descubrir fármacos.
¿Cuál es la diferencia entre NGS y WGS?
NGS es una tecnología de secuenciación masivamente paralela de segunda generación que es de alto rendimiento, bajo costo y rápida, mientras que WGS es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula en un solo momento mediante el uso de técnicas de secuenciación como como secuenciación de Sanger, enfoque de escopeta o secuenciación NGS de alto rendimiento. Entonces, esta es la diferencia clave entre NGS y WGS. Además, NGS consta solo de métodos de secuenciación de segunda generación, mientras que WGS consta de métodos de secuenciación de primera, segunda y tercera generación.
La siguiente tabla presenta las diferencias entre NGS y WGS en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen: NGS frente a WGS
En las últimas décadas, se han aplicado rutinariamente diferentes técnicas de secuenciación en la investigación molecular contemporánea. E incluso son herramientas muy poderosas para muchas aplicaciones clínicas. NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que se están incorporando actualmente en muchos proyectos genómicos. NGS es una tecnología de secuenciación de segunda generación de alto rendimiento, bajo costo y rápida. Por otro lado, WGS es un método para analizar el ADN genómico completo o el ADN genómico completo de una célula en un solo momento mediante el uso de técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre NGS y WGS.
