La diferencia clave entre dNTP y ddNTP es que dNTP o desoxirribonucleótidos son los componentes básicos del ADN y tienen un grupo 3ʹ-OH en la estructura del azúcar pentosa, mientras que ddNTP o didesoxinucleósido trifosfato son nucleótidos que carecen del grupo 3ʹ-OH y se utilizan en la técnica de secuenciación de ADN dideoxi de Sanger para producir secuencias de ADN de diferente longitud.
dNTP y ddNTP son nucleótidos. dNTP se refiere a nucleótidos de desoxirribosa. Son los componentes básicos del ADN. Los dNTP se utilizan para sintetizar ADN. dNTP, por otro lado, se refiere a trifosfatos de didesoxinucleósido. Se utilizan en la secuenciación de Sanger para terminar la síntesis de ADN en diferentes longitudes. Carecen del grupo OH en la posición 3ʹ. Un hidrógeno está presente en la posición 3ʹ en lugar del grupo OH. Por lo tanto, los ddNTP no pueden formar un enlace fosfodiéster con el siguiente nucleótido. dNTP es capaz de llevar a cabo la síntesis de ADN, mientras que ddNTP es capaz de terminar la polimerización de ADN.
¿Qué es dNTP?
dNTP significa nucleótido de desoxirribosa o desoxirribonucleótido. Es el componente básico del ADN. Hay cuatro tipos de dNTP. Son dATP, dTTP, dCTP y dGTP. Se denominan según las bases nitrogenadas púricas o pirimidínicas: Adenina (A), Guanina (G), Timina (T) y Citosina (C).
Figura 01: dNTP
La adenina y la guanina son bases de purina, mientras que la timina y la citosina son bases de pirimidina. El azúcar pentosa de dNTP es desoxirribosa. También hay un grupo fosfato. Por tanto, el dNTP está compuesto por tres componentes: una base nitrogenada, azúcar desoxirribosa y un grupo fosfato. Estos dNTP se combinan entre sí a través de enlaces fosfodiéster. En los dNTP, hay un grupo OH unido a la posición 3' del azúcar pentosa que se requiere para formar un enlace con el grupo fosfato unido al carbono 5' del azúcar del siguiente nucleótido. Dado que todos los dNTP tienen este grupo 3ʹ -OH, son capaces de sintetizar y extender cadenas de ADN. Por lo tanto, dNTP actúa como la unidad de repetición básica del ADN y la materia química de los genes. La síntesis de ADN siempre procede de 5ʹ a 3ʹ.
¿Qué es DdNTP?
La secuenciación de Sanger es un método de secuenciación de ADN de primera generación desarrollado por Frederick Sanger y sus colegas en 1977. También se conoce como secuenciación de terminación de cadena o secuenciación dideoxiya que el principio básico de este método es la terminación de la cadena utilizando trifosfatos de dideoxinucleósido (ddNTP). Los ddNTP son nucleótidos utilizados en la secuenciación de Sanger. La secuenciación de Sanger se basa en la incorporación selectiva de ddNTP y la terminación de la síntesis de ADN durante la replicación del ADN in vitro. La especialidad de los ddNTP es que carecen del grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa para continuar la formación de enlaces fosfodiéster entre el grupo fosfato de 5ʹ en el nucleótido adyacente. Por lo tanto, una vez que se une un ddNTP a la hebra que se extiende, el alargamiento de la cadena cesa y termina desde ese punto. Los ddNTP actúan como inhibidores de la polimerasa de ADN que alargan la cadena durante el método de secuenciación de Sanger.
Figura 02: ddNTP
Hay cuatro ddNTP: ddATP, ddCTP, ddGTP y ddTTP utilizados en la secuenciación de Sanger. Estos nucleótidos detienen el proceso de replicación del ADN cuando se incorporan a la hebra de ADN en crecimiento. Como resultado, la secuenciación de Sanger produce longitudes variables de ADN corto. La electroforesis en gel capilar se usa para organizar estas cadenas cortas de ADN por sus tamaños en un gel. Los ddNTP se marcan de forma radiactiva o fluorescente con diferentes colores para facilitar el análisis de la secuencia de ADN. Al analizar el gel, se puede determinar la secuencia de nucleótidos de la hebra de ADN desconocida.
¿Cuáles son las similitudes entre dNTP y DdNTP?
- Tanto dNTP como ddNTP se utilizan en la secuenciación de Sanger.
- Hay cuatro tipos de dNTP y ddNTP.
- Están compuestos por tres componentes: una base nitrogenada, azúcar desoxirribosa y grupos fosfato.
¿Cuál es la diferencia entre dNTP y DdNTP?
dNTP es uno de los cuatro tipos de desoxirribonucleótidos que son componentes básicos del ADN. ddNTP es uno de los cuatro tipos de didesoxirribonucleósido trifosfato utilizados en la técnica de secuenciación de Sanger. dNTP tiene un grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa, mientras que ddNTP carece del grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre dNTP y ddNTP. Además, los dNTP llevan a cabo la polimerización del ADN, mientras que los ddNTP terminan la polimerización del ADN. Por lo tanto, esta es otra gran diferencia entre dNTP y ddNTP.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre dNTP y ddNTP en forma tabular.
Resumen: dNTP frente a DdNTP
Los dNTP normales son componentes básicos del ADN, mientras que los ddNTP son nucleótidos que se utilizan en la técnica de secuenciación de Sanger. dNTP tiene 3ʹ-OH mientras que ddNTP carece de 3ʹ-OH. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre dNTP y ddNTP. Además, dNTP puede sintetizar una cadena de ADN mientras que ddNTP puede terminar la polimerización de ADN. Por lo tanto, los ddNTP se utilizan en la secuenciación de Sanger para producir diferentes hebras de ADN con diferentes longitudes. Durante la secuenciación de Sanger, se incluyen tanto dNTP como ddNTP.
