La diferencia clave entre synteny y colinealidad es que synteny es la co-localización física de loci genéticos en el mismo cromosoma en especies, mientras que la colinealidad es la co-localización física de loci genéticos en el mismo cromosoma en diferentes especies conservando el mismo orden.
Synteny y colinealidad son dos términos que se usan indistintamente en genómica. Ambos términos describen los patrones de localización de genes en los cromosomas en diferentes especies. Estos arreglos de genes relacionados entre los taxones son información valiosa cuando se infiere la ascendencia compartida de genes. Synteny se refiere a la colocalización física de loci genéticos en el mismo cromosoma en especies. La colinealidad se refiere a la colocalización física de loci genéticos en el mismo cromosoma en diferentes especies conservando el mismo orden. Por lo tanto, es una forma de synteny.
¿Qué es Synteny?
En diferentes especies, hay un conjunto de genes ubicados en el mismo cromosoma. Y esta colocalización física de genes en el mismo cromosoma en diferentes especies se conoce como synteny. Además, estos genes se encuentran muy cerca unos de otros en un solo cromosoma. El orden de los genes puede no ser necesariamente el mismo. Pero, la localización de genes cerca unos de otros en el mismo cromosoma tiene lugar en sintonía. Por lo tanto, synteny describe principalmente el patrón de distribución de genes en un cromosoma. Estos patrones de colocalización de genes indican relaciones entre diferentes especies y su evolución. Sin embargo, la sintenia puede verse interrumpida debido a reordenamientos cromosómicos como translocaciones, inversión y fusión cromosómica, etc., duplicaciones, pérdidas y recombinación homóloga desigual.
Figura 01: Synteny
Se cree que todos los genes vinculados son sinténicos. Sin embargo, no todos los genes sinténicos están necesariamente vinculados. Poseen secuencias cromosómicas comunes. Los humanos tienen muchos genes sinténicos con otros mamíferos. Además, muchos cereales tienen genes sinténicos.
¿Qué es la colinealidad?
La colinealidad es una forma más específica de sintenia en la que un conjunto de genes se ubican en el mismo cromosoma de diferentes especies en el mismo orden que en la especie ancestral. Por lo tanto, si hay una desviación de la colinealidad, será un carácter filogenético más confiable ya que la colinealidad explica la ascendencia compartida de los genes.
Figura 02: Colinealidad
El análisis de colinealidad de varias vías brinda información mucho más confiable sobre las especies relacionadas y su filogenia.
¿Cuáles son las similitudes entre la sintenía y la colinealidad?
- Tanto en sintenía como en colinealidad, un conjunto de loci en dos especies diferentes se encuentra en el mismo cromosoma.
- Estos términos describen la colocalización física de loci genéticos en el mismo cromosoma.
- La colinealidad es una forma más específica de sintenía.
- A veces ambos términos se usan indistintamente en genómica.
- Si dos regiones tienen colinealidad, obviamente son sintéticas.
- Son útiles para inferir la filogenia.
¿Cuál es la diferencia entre sintenía y colinealidad?
Synteny y colinealidad son dos términos que se usan indistintamente en genómica. Synteny se refiere a la colocalización física de un conjunto de genes en el mismo cromosoma en diferentes especies. La colinealidad es una forma de sintenía en la que el conjunto de genes se co-localizan en el mismo orden entre las diferentes especies. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre sintenía y colinealidad.
Resumen: Synteny frente a colinealidad
Los términos sintenía y colinealidad se refieren a un conjunto de genes que se encuentran en el mismo cromosoma en diferentes especies. De hecho, estos genes están co-localizados en el mismo cromosoma en diferentes especies. Synteny describe la colocalización física de conjuntos de genes en el mismo cromosoma en diferentes especies, mientras que la colinealidad es una forma más específica de synteny en la que el conjunto de genes se colocaliza en el mismo orden. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre sintenía y colinealidad.
