La diferencia clave entre homología y similitud en bioinformática es que la homología se refiere a una declaración sobre la ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud se refiere al grado de similitud entre dos secuencias.
La bioinformática es un campo de la ciencia que combina la biología, la ingeniería de la información, la informática, las matemáticas y la estadística para analizar e interpretar datos biológicos. Homología y similitud son dos términos que utilizamos en el campo de la bioinformática. Podemos calcular fácilmente la similitud como un porcentaje de residuos similares sobre una longitud determinada de la alineación. Sin embargo, no podemos calcular la homología ya que puede ser verdadera o falsa y generalmente depende de la hipótesis utilizada.
¿Qué es la homología en bioinformática?
La homología en bioinformática se refiere a la homología biológica entre secuencias de ADN, ARN y proteínas que se definen en términos de propiedades ancestrales compartidas en el árbol evolutivo de la vida. En otras palabras, es la ascendencia evolutiva común de dos secuencias. El motivo de tal ocurrencia podría deberse a eventos de especiación (ortólogos), eventos de transferencia horizontal de genes (xenólogos) o eventos de duplicación (parálogos).
Figura 01: Alineación de secuencia múltiple
Es posible deducir la homología entre ADN, ARN o proteínas por su similitud de secuencia de aminoácidos o nucleótidos. Una similitud significativa sirve como una fuerte propiedad probatoria para inferir que dos secuencias están relacionadas con una secuencia ancestral común con cambios evolutivos. Los alineamientos de múltiples secuencias indican las regiones de cada secuencia con naturaleza homóloga.
¿Qué es la similitud en bioinformática?
En bioinformática, la similitud evalúa la similitud entre dos proteínas o secuencias de nucleótidos. Hay dos pasos principales en este proceso. El paso inicial es la alineación por pares, que ayuda a encontrar la alineación óptima entre dos secuencias (incluidos los espacios) mediante algoritmos como BLAST, FastA y LALIGN. Después de la alineación por pares, es necesario obtener dos parámetros cuantitativos de cada comparación por pares. Son identidad y semejanza. En BLAST, las similitudes de búsqueda se conocen como positivas.
Figura 02: Alineación por pares
Una mutación conservativa se produce cuando un aminoácido muta a un residuo similar conservando las propiedades fisicoquímicas. Por ejemplo, si la arginina muta a lisina con +1 carga positiva, se acepta ya que los dos aminoácidos tienen propiedades similares y no cambian la proteína traducida. Por lo tanto, las medidas de similitud dependen de los criterios de cómo dos residuos de aminoácidos son entre sí.
¿Cuáles son las similitudes entre homología y similitud en bioinformática?
- Homología y similitud son dos términos técnicos que encontramos en la bioinformática.
- Además, ambos términos se refieren al análisis molecular de secuencias.
¿Cuál es la diferencia entre homología y similitud en bioinformática?
La homología se refiere a una declaración sobre la ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud se refiere al grado de similitud entre dos secuencias. Entonces, esta es la diferencia clave entre homología y similitud en bioinformática. Además, la homología no se puede calcular ya que podría ser verdadera o falsa y, por lo general, depende de la hipótesis, mientras que la similitud se puede calcular fácilmente como un porcentaje de residuos similares en una longitud determinada de la alineación. Por lo tanto, esta es una diferencia significativa entre homología y similitud en bioinformática.
La siguiente infografía enumera la diferencia entre homología y similitud en bioinformática.
Resumen: Homología frente a similitud en bioinformática
En resumen, la diferencia clave entre homología y similitud en bioinformática radica en sus definiciones. La homología es una declaración de ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud es la semejanza entre dos secuencias. La homología se produce debido a ortólogos, parálogos y xenólogos. Al deducir la similitud, es posible utilizar algoritmos como FastA, BLAST y LALIGN. La homología no puede expresarse como un cálculo, pero la similitud podría expresarse como un porcentaje de residuos similares en una longitud dada de la alineación. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre homología y similitud en bioinformática.
