Diferencia clave: genotipado frente a secuenciación
El genotipado y la secuenciación son dos técnicas que se realizan para obtener información sobre los ácidos nucleicos, principalmente el ADN de un organismo. La diferencia clave entre el genotipado y la secuenciación es que el genotipado es el proceso de determinar qué variante genética posee el individuo usando marcadores, mientras que la secuenciación es la determinación del orden correcto de la secuencia de nucleótidos dentro del fragmento de ADN dado.
¿Qué es el genotipado?
La genotipificación es la determinación de la composición genética de un individuo utilizando una secuencia de ADN y marcadores y la comparación e identificación de su herencia. La genotipificación es importante en biología evolutiva, biología de poblaciones, taxonomía, ecología y genética de los organismos. Se puede realizar mediante diferentes técnicas que incluyen secuenciación de ADN, reacción en cadena de la polimerasa, polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP), detección polimórfica amplificada aleatoria, polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLP), micromatrices de ADN, etc.
La genotipificación implica la secuenciación de pequeños fragmentos particulares de secuencias de ADN y la búsqueda de la relación de la composición genética con otros individuos utilizando marcadores genéticos. Determina los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) entre los individuos o los alelos específicos. La genotipificación es aplicable a una amplia gama de organismos, incluidos los humanos. También es aplicable a microorganismos como virus, hongos, etc. y puede utilizarse para determinar sus variantes genéticas con los perfiles de referencia. En epidemiología molecular y microbiología forense, el control de patógenos, especialmente de microorganismos, se realiza mediante la información obtenida del genotipado. La genotipificación es muy importante en el análisis de pedigrí. Los humanos son genotipados para confirmar la maternidad y la paternidad. El genotipo revelará los alelos dominantes y recesivos de los genes que deciden los rasgos específicos.
Figura_1: Genotipado RFLP
¿Qué es la secuenciación?
La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto del nucleótido en un fragmento dado de ADN o ARN. Prácticamente toda la información requerida para el crecimiento y desarrollo de un organismo está codificada en su genoma. La disponibilidad de técnicas para producir y separar fragmentos de ácidos nucleicos de unos cientos de nucleótidos de largo condujo al desarrollo de procedimientos para determinar la secuencia exacta de nucleótidos de un fragmento dado de ADN o ARN. En la actualidad se dispone de diferentes tipos de métodos de secuenciación. Estos métodos de secuenciación, junto con las tecnologías para la construcción de bibliotecas genómicas que representan el genoma completo de un organismo, facilitan la secuenciación de todo el genoma de ese organismo, haciendo un análisis en profundidad de las estructuras de los genes, las funciones de los genes, las ubicaciones de los genes, las expresiones de los genes, mapeo de genes, regiones reguladoras de genes, etc.
Los genomas totales de muchos virus, varias bacterias, arqueobacterias, levaduras y varios otros organismos han sido secuenciados y mapeados. El proyecto del genoma humano ha hecho posible secuenciar y mapear todo el genoma humano y publicar su primer borrador en 2003. Es un hito importante en el avance de la biología. Las secuencias del genoma humano ahora se utilizan en el sector médico para identificar causas genéticas de enfermedades raras, evaluar el riesgo de enfermedades en recién nacidos, identificar detalles genéticos de diferentes tipos de cáncer, desarrollar nuevas terapias y desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, etc.
En el mundo de las plantas, se han secuenciado el genoma del arroz y los genomas de Arabidopsis. El conocimiento de estas secuencias sin duda revolucionará nuestra comprensión de cómo funcionan las células y los organismos.
Figura_2: Una autorradiografía de la secuenciación de Sanger
¿Cuál es la diferencia entre genotipado y secuenciación?
Genotipificación versus secuenciación |
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| La genotipificación es el proceso de determinar la composición genética de un individuo y verificar el grupo o la taxonomía de ese organismo. | La secuenciación es el proceso de determinar el orden preciso de los nucleótidos de un fragmento de ADN o ARN dado. |
| Técnicas | |
| RFLP, secuenciación de genes, PCR, micromatrices de ADN, AFLP, etc. | Secuenciación de Sanger, secuenciación de Gilbert, pirosecuenciación, secuenciación de próxima generación, secuenciación de escopeta, etc. |
| Principales preocupaciones | |
| Esto tiene más que ver con si las diferencias de genotipo están dando las diferencias reales de fenotipo. | Esto está más preocupado por el orden de los nucleótidos y sus diferencias y cambios con otros organismos. |
Resumen: genotipado frente a secuenciación
La genotipificación y la secuenciación son útiles para estudiar la información genética de los organismos. La genotipificación es el proceso de determinar las variaciones genotípicas entre individuos y encontrar sus categorías. La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto de los nucleótidos en el fragmento interesado o la región de ADN. Ambas técnicas proporcionan información importante sobre los genes y los genomas.
