Agarosa frente a poliacrilamida
La agarosa y la poliacrilamida son polímeros solubles en agua pero, entre ellos, se pueden ver muchas diferencias, comenzando por su origen. Tanto la agarosa como la poliacrilamida tienen algo en común en su capacidad para formar matrices de gel poroso. A pesar de esto, existen una serie de diferencias claras entre los dos. Las principales diferencias entre estos dos polímeros radican en su naturaleza de origen, estructura química, sus diferentes usos y su rendimiento en términos de electroforesis en gel.
¿Qué es la agarosa?
La agarosa es un polímero lineal de origen natural que a su vez se deriva de un polímero complejo llamado agar que se encuentra en las algas marinas. La agarosa se extrae del agar mediante la eliminación de su componente proteico llamado agaropectina. La agarosa es lo que le da al agar su capacidad para formar geles.
El principal uso de la agarosa es en estudios microbiológicos y de biología molecular. En estudios microbiológicos, la agarosa, cuando se complementa con los nutrientes adecuados, proporciona una base sólida para el cultivo de microorganismos como bacterias y hongos. Cuando se usa en concentraciones semisólidas, puede ser útil para evaluar la motilidad de estos microorganismos. En biología molecular, sirve como una herramienta importante para uno de los procesos de resolución más fundamentales llamado 'electroforesis en gel' o 'electroforesis en gel de agarosa' (AGE). La electroforesis en gel es un proceso que permite la resolución o separación de ácidos nucleicos o proteínas en función de su tamaño y carga. Aquí, la agarosa sirve como un gel poroso similar a un tamiz a través del cual ocurre la separación.
Estructura de agarosa
¿Qué es la poliacrilamida?
La poliacrilamida es un polímero sintético y se utiliza en una amplia variedad de industrias. Como se mencionó anteriormente, su uso se basa en su capacidad para formar geles. Sin embargo, además de esto, su capacidad para retener y drenar el agua en diferentes concentraciones también se explota en varias industrias.
El uso más extendido y común de la poliacrilamida es en el tratamiento de aguas residuales. Aquí, se utiliza como agente floculante para eliminar cualquier material orgánico en suspensión; por lo tanto, mejora la turbidez y clarifica el agua. Otro uso de la poliacrilamida es en la industria del papel. Aquí, se usa para retener o drenar el agua de la pulpa de papel según sea necesario. Del mismo modo, en las industrias agrícola y de la construcción, se utiliza como acondicionador del suelo para evitar la erosión del suelo y mejorar su calidad.
Al igual que la agarosa, la poliacrilamida también se utiliza en biología molecular como una importante herramienta de resolución en un proceso similar denominado "electroforesis en gel de poliacrilamida" (PAGE). Además de todo esto, la poliacrilamida también se usa en el procesamiento de minerales y en la fabricación de agentes floculantes para eliminar cualquier material orgánico en suspensión; por lo tanto, mejora la turbidez y clarifica el agua. Otro uso de la poliacrilamida es en la industria del papel. Aquí, se usa para retener o drenar el agua de la pulpa de papel según sea necesario. De igual forma, en las industrias agrícola y de la construcción, se utiliza como acondicionador de suelos para evitar la erosión del suelo y mejorar su calidad. Además de todo esto, la poliacrilamida también se utiliza en la fabricación de aditivos alimentarios, lentes de contacto blandas y textiles.
Estructura de poliacrilamida
¿Cuál es la diferencia entre la agarosa y la poliacrilamida?
Origen de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: La agarosa es un polímero de origen natural. Se deriva de algas marinas.
Poliacrilamida: La poliacrilamida es de origen sintético y no se encuentra en ninguna circunstancia natural.
Fórmula molecular de agarosa y poliacrilamida:
Agarosa: La fórmula molecular de la agarosa es C24H38O19.
Poliacrilamida: La fórmula molecular de la poliacrilamida es (C 3H5NO)n.
Estructura química de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: La agarosa es un polisacárido lineal. Se compone de unidades repetitivas de disacárido llamadas agrobiosa que se mantienen unidas por enlaces de hidrógeno.
Poliacrilamida: La poliacrilamida es un polímero reticulado químicamente. Está compuesto por monómeros de acrilamida y un agente reticulante N,N'-metilenbisacrilamida.
Toxicidad de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: tanto la agarosa como su unidad monomérica agrobiosa no son tóxicos por naturaleza.
Poliacrilamida: la unidad monomérica de la poliacrilamida, la acrilamida, es un presunto carcinógeno y una neurotoxina conocida, mientras que su forma polimerizada no es tóxica por naturaleza.
Características de los geles de agarosa y poliacrilamida:
EDAD y PÁGINA:
Agarosa: la preparación de gel de agarosa para AGE requiere menos tiempo, es fácil y simple, y no requiere un iniciador o catalizador de polimerización.
Poliacrilamida: la preparación del gel de poliacrilamida para PAGE requiere mucho tiempo y es tediosa, y también requiere un iniciador (persulfato de amonio) y un catalizador de polimerización (N, N, N', N'-tetrametiletilendiamina - TEMED).
Naturaleza:
Los geles de poliacrilamida son químicamente más estables que los geles de agarosa.
Tamaño del poro:
Dada la misma concentración, las matrices de gel de poliacrilamida tienden a tener tamaños de poro más pequeños en comparación con una matriz de gel de agarosa.
Alteración del tamaño de los poros:
El tamaño de los poros de los geles de poliacrilamida se puede modificar de forma más controlada que los geles de agarosa.
Poder de resolución:
Los geles de poliacrilamida tienen un poder de resolución alto, mientras que los geles de agarosa tienen un poder de resolución bajo.
Acomodación de ácido nucleico:
Los geles de poliacrilamida pueden acomodar mayores cantidades de ácido nucleico que los geles de agarosa para la resolución.
