La diferencia clave entre los isoesquizomeros y los neoesquizomeros es que los isoesquizomeros son enzimas de restriccion que tienen la misma secuencia de reconocimiento y escinden el ADN en las mismas posiciones, mientras que los neoesquizomeros son enzimas de restriccion que tienen la misma secuencia de reconocimiento pero escinden el ADN en posiciones diferentes.
Las enzimas de restricción o las endonucleasas de restricción son enzimas que dividen el ADN en fragmentos en o cerca de sitios de reconocimiento específicos. Cortan el ADN en los sitios de restricción. Las enzimas de restricción generalmente se clasifican en cinco grupos según la estructura, si cortan su sustrato de ADN en su sitio de reconocimiento y si los sitios de reconocimiento y división están separados entre sí. Ya se han identificado más de 3600 endonucleasas de restricción. Aproximadamente 800 enzimas de restricción están disponibles comercialmente. Los isoesquizómeros y los neoesquizómeros son dos tipos de enzimas de restricción basadas en el sitio de reconocimiento y la especificidad de escisión.
¿Qué son los isoesquizómeros?
Los isoesquizómeros son enzimas de restricción que tienen la misma secuencia de reconocimiento y escinden el ADN en las mismas posiciones. Estas enzimas de restricción tienen la misma especificidad. La primera enzima de restricción descubierta que reconoce una secuencia dada se conoce como prototipo, mientras que todas las enzimas de restricción identificadas posteriormente que reconocen esa misma secuencia se denominan isosquizómeros. Sin embargo, los isosquizómeros pueden diferir en las preferencias de sitio, las condiciones de reacción, la sensibilidad a la metilación y la actividad estelar. Los isoesquizómeros se aíslan de diferentes cepas de bacterias. Por lo tanto, pueden requerir diferentes condiciones de reacción. En algunos casos, solo uno de un par de isoesquizómeros puede reconocer formas de sitios de restricción tanto metiladas como no metiladas. Por otro lado, la otra enzima de restricción puede reconocer solo la forma no metilada del sitio de restricción. Esta característica particular de los isosquizómeros ayuda a identificar el estado de metilación del sitio de restricción mientras lo aísla de un estado bacteriano.
Por ejemplo, AgeI y BshT1 reconocen y dividen 5'-A↓CCGGT en el mismo patrón. HpaII y MSPI son otros pares de isosquizómeros. Ambos reconocen la secuencia 5'-C↓CGG-3' cuando no está metilada. Pero cuando la segunda C de la secuencia está metilada, solo MSPI puede reconocer esta secuencia mientras que HpaII no puede reconocerla.
¿Qué son los neoesquizómeros?
Los neoesquizómeros son enzimas de restricción que tienen la misma secuencia de reconocimiento pero escinden el ADN en diferentes posiciones. En algunas aplicaciones biológicas moleculares especiales, esta es una característica muy útil. Los neoesquizómeros son un subconjunto de los isosquizómeros. Ejemplos bien conocidos de neoesquizómeros son SmaI (5'-CCC↓GGG-3') y XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); ambos reconocen la secuencia 5'-CCCGGG-3' pero los escinden en una posición diferente. Así, estas dos enzimas de restricción generan diferentes tipos de extremos. En este caso, SmaI produce puntas romas y XmaI produce puntas sobresalientes de 5'.
Figura 01: Neoesquizómeros
Otro ejemplo es el par de enzimas de restricción MaeII y Tail. El prototipo MaeII (A↓CGT) produce fragmentos de ADN con una extensión de 5' de 2 bases, y el neoesquizómero Tail (ACGT↓) produce fragmentos de ADN con una extensión de 4 bases 3'.
¿Cuáles son las similitudes entre los isoesquizómeros y los neoesquizómeros?
- Los isoesquizómeros y los neoesquizómeros son dos tipos de enzimas de restricción.
- Se encuentran predominantemente en procariotas.
- Son parte del sistema de restricción-modificación (RM) que se encuentra en bacterias y arqueas.
- Ambas son moléculas de proteína.
- Ambos dividen el ADN en fragmentos.
¿Cuál es la diferencia entre isoesquizómeros y neoesquizómeros?
Los isoesquizómeros son enzimas de restricción que tienen la misma secuencia de reconocimiento y escinden el ADN en las mismas posiciones, mientras que los neoesquizómeros son enzimas de restricción que tienen la misma secuencia de reconocimiento pero escinden el ADN en posiciones diferentes. Entonces, esta es la diferencia clave entre los isoesquizómeros y los neoesquizómeros. Además, los isoesquizómeros tienen las mismas especificidades, mientras que los neoesquizómeros tienen especificidades diferentes.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre los isoesquizómeros y los neoesquizómeros en forma tabular para compararlos uno al lado del otro.
Resumen: isoesquizomeros y neoesquizomeros
Las enzimas de restricción son enzimas que cortan el ADN. También se les llama tijeras moleculares. Hay diferentes tipos de enzimas de restricción. Según el sitio de reconocimiento y la especificidad de escisión, las enzimas de restricción son de dos tipos, como isosquizómeros y neoesquizómeros. Los isoesquizómeros tienen la misma secuencia de reconocimiento y escinden el ADN en las mismas posiciones, mientras que los neoesquizómeros tienen la misma secuencia de reconocimiento pero escinden el ADN en diferentes posiciones. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre los isoesquizomeros y los neoesquizomeros.
