La diferencia clave entre LINE y SINE es que los LINE (elementos nucleares intercalados largos) son un tipo de retrotransposones no LTR más largos, mientras que los SINE (elementos nucleares intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones no LTR mucho más cortos.
Los retrotransposones no LTR no contienen repeticiones terminales largas (LTR). Sin embargo, contienen genes para la transcriptasa inversa, la proteína de unión al ARN, la nucleasa y el dominio H de la ribonucleasa. Los retrotransposones que no son LTR tienen repeticiones cortas. Estas repeticiones tienen un orden invertido de bases una al lado de la otra. Aparte de eso, los retrotransposones que no son LTR también tienen repeticiones directas que se encuentran en los transposones LRT. Los retrotransposones que no son LTR se dividen en dos categorías como LINE y SINE.
¿Qué son las LÍNEAS?
LINEs (elementos nucleares intercalados largos) son retrotransposones no LTR más largos. Están muy extendidos en los genomas de los eucariotas. Suelen constituir el 21,1% del genoma humano. Cada LÍNEA tiene alrededor de 7000 pares de bases de largo. Los LINE pueden transcribirse en ARNm y traducirse en una proteína que puede funcionar como una enzima transcriptasa inversa. Esta transcriptasa inversa produce copias de ADN del ARN de LINE. Estas copias de ADN se pueden integrar en el genoma en un nuevo sitio.
Figura 01: LÍNEAS y SENOS
El genoma humano tiene solo una LÍNEA abundante llamada LÍNEA-1. El elemento LINE-1 tiene una longitud de alrededor de 6000 pares de bases. Hay alrededor de 100.000 elementos LINE-1 truncados en el genoma humano. La mutación aleatoria puede ocurrir en LINE. Debido a mutaciones aleatorias, las LÍNEAS pueden degenerar. Ya no se transcriben ni se traducen. Además, las LÍNEAS se agrupan en cinco grupos principales, como L1, RTE, R2, I y jockey. Estos cinco grupos se subdividen en otros 28 clados.
LINEs normalmente se propagan a través de un mecanismo llamado mecanismo de transcripción inversa cebado por destino (TPRT). La inserción de LINE causa enfermedades humanas como hemofilia A, cáncer, trastornos mendelianos, etc. La hipometilación de LINE también desencadena ciertos tipos de cáncer.
¿Qué son los SENOS?
Los SINE (elementos nucleares intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones no LTR mucho más cortos. Tienen alrededor de 100 a 700 pares de bases de longitud. Los SINE también son elementos de ADN que se amplifican a lo largo de los genomas eucariotas a través de intermediarios de ARN. Los SINE constituyen aproximadamente el 13% del genoma de los mamíferos. Las regiones internas de los SINE se originan a partir del ARNt. Sigue estando muy conservado. A menudo están presentes en muchas especies de vertebrados e invertebrados. La variación del número de copias y las mutaciones en los SINE se pueden incorporar para construir la clasificación de especies basada en la filogenia.
Los SINE se pueden agrupar en tres tipos principales: CORE-SINE, V-SINE y AmnSINE. El elemento Alu es el SINE más común en los primates. Además, hay más de 50 enfermedades humanas asociadas con la inserción de SINE. Cuando se insertan dentro o cerca de los exones, pueden causar un empalme inadecuado o cambiar el marco de lectura. Esto conduce a fenotipos de enfermedades como cáncer de mama, cáncer de colon, leucemia, hemofilia, fibrosis quística, cáncer de colon, enfermedad de Dent, neurofibromatosis, etc.
¿Cuáles son las similitudes entre LÍNEAS y SENOS?
- LINEs y SINEsson dos tipos de retrotransposones no LTR.
- Ninguno tiene regiones terminales largas (LTR).
- Ambos se encuentran predominantemente solo en eucariotas.
- Ambos son no autónomos.
¿Cuál es la diferencia entre LÍNEAS y SENOS?
LINEs son retrotransposones no LTR más largos, mientras que SINE son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Entonces, esta es la diferencia clave entre LINE y SINE. Además, LINES codifica la enzima transcriptasa inversa, mientras que SINE no codifica la enzima transcriptasa inversa. Por lo tanto, esta es otra diferencia entre LÍNEAS y SENOS.
Más diferencias entre LINE y SINE se enumeran a continuación en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen: LÍNEAS frente a SENOS
Los retrotransposones se encuentran principalmente en todos los eucariotas pero están ausentes en los procariotas. Aproximadamente, el 37% del genoma humano contiene retrotransposones. Los retrotransposones son principalmente de dos tipos: retrotransposones LTR y no LTR. Los retrotransposones que no son LTR no contienen repeticiones terminales largas (LTR), que están presentes en los retrotransposones LTR. Los retrotransposones que no son LTR se dividen además en dos categorías: LINE y SINE. Los LINE son retrotransposones no LTR más largos, mientras que los SINE son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre LÍNEAS y SENOS.
