La diferencia clave entre ITS1 e ITS2 es que ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas.
El espaciador transcrito interno (ITS, por sus siglas en inglés) es el espaciador de ADN que generalmente se encuentra entre los genes de ARN ribosomal de subunidad pequeña y ARN ribosomal de subunidad grande en el cromosoma o en la región transcrita correspondiente en la molécula de transcripción precursora de ARNr policistrónico. En bacterias y arqueas, solo hay un único ITS entre los genes 16S y 23S rRNA. Pero en eucariotas, hay dos ADN espaciadores ITS: ITS1 (entre 18S y 5.genes 8S rRNA) e ITS2 (entre 5.8S y 28S rRNA). Por lo tanto, ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciadores que se encuentran entre los genes de ARNr en eucariotas.
¿Qué es ITS1?
ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre los genes 18S y 5.8S rRNA en eucariotas. ITS se refiere a una pieza de ADN espaciador no funcional ubicado entre los genes de ARNr. ITS1 tiene una mayor variación de longitud que ITS2. La variación de longitud de ITS1 es de aproximadamente (200-300 pb). Los marcadores ITS como ITS1 han demostrado su eficacia para dilucidar las relaciones filogenéticas entre diferentes taxones. Además, el ADN espaciador ITS1 está menos conservado que el ADN espaciador ITS2. Las estructuras ITS1 solo se conservan en unidades taxonómicas mucho más pequeñas. Cada grupo ribosómico eucariótico también contiene regiones denominadas espaciadores transcritos externos (5' y 3' ETS).
Figura 01: Región ITS1
El ADN del espaciador ITS1 está muy cerca del espaciador transcrito externo 5' (5' ETS). Además, si alguien quiere amplificar la región ITS1 para estudios de relaciones filogenéticas, debe usar un par de cebadores específicos (cebadores inversos y directos) para este propósito. Para amplificar la región ITS1, normalmente se utilizan dos conjuntos de cebadores en los protocolos de PCR de los laboratorios. Son ITS1 adelante e ITS2 atrás o ITS1 adelante e ITS4 atrás.
¿Qué es ITS2?
ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes 5.8S y 28S rRNA en eucariotas. La región ITS2 tiene una variación de longitud más corta que la región ITS1. La variación de longitud de ITS2 es de aproximadamente (180-240 pb). Sin embargo, la región ITS2 está más conservada que la región ITS1 en muchas unidades taxonómicas. Identifica que todas las secuencias ITS2 comparten un núcleo común de estructura secundaria. Además, el 40 % de la región ITS2 se conserva entre todas las angiospermas, mientras que es posible alinear el 50 % de la región ITS2 entre la familia y el nivel superior.
Figura 02: Región ITS2
Independientemente del alcance de la conservación, el uso de la región ITS2 también es muy popular, como la región ITS1, en estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en códigos de barras de ADN de hongos. Para amplificar la región ITS2, generalmente se usa un conjunto de cebadores específicos en los protocolos de PCR de los laboratorios. Eso es ITS1 hacia adelante e ITS4 hacia atrás. Pero cuando el protocolo PCR usa este conjunto de cebadores, también amplifica la región ITS1 junto con la región ITS2. Además, el ADN del espaciador ITS2 está muy cerca del espaciador transcrito externo 3' (3' ETS).
Similitudes entre ITS1 y ITS2
- ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciadores ubicados entre genes de ARNr.
- Solo están presentes en eucariotas.
- Ambos se pueden amplificar usando pares de cebadores específicos.
- Ambos se eliminan en la maduración del ARNr como subproductos no funcionales.
- Ambos son muy importantes para los estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en el código de barras del ADN fúngico.
Diferencia entre ITS1 y ITS2
ITS1 es un ADN espaciador presente entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas. Entonces, esta es la diferencia clave entre ITS1 e ITS2. Además, ITS1 tiene una mayor variación de longitud en comparación con ITS2. Por otro lado, ITS2 tiene una variación de longitud más corta en comparación con ITS1. Esta es otra diferencia entre ITS1 e ITS2.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre ITS1 e ITS2 en forma tabular para compararlas lado a lado.
Resumen: ITS1 frente a ITS2
La región transcrita interna (ITS) es una pieza no funcional de ADN espaciador ubicada entre los genes de ARNr. En bacterias y arqueas, solo hay una única región ITS. Pero en eucariotas, hay dos regiones ITS: ITS1 e ITS2. ITS1 es un ADN espaciador que se encuentra entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador que se encuentra entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre ITS1 e ITS2.
