La diferencia clave entre la metagenómica y la metatranscriptómica se basa en el tipo de biomoléculas estudiadas en cada área. La metagenómica estudia el ADN, sus secuencias y su comportamiento en los organismos, mientras que la metatranscriptómica estudia el ADN transcrito, principalmente las secuencias de ARNm y su comportamiento en los organismos.
La metagenómica y la metatranscriptómica son dos campos que han ganado mucha popularidad a lo largo de los años en relación con la comunidad microbiana. Son importantes en el cuidado de la salud, la industria y la biotecnología agrícola. Tanto la metagenómica como la metatranscriptómica permiten el estudio de organismos individuales en una comunidad y sus roles funcionales que son beneficiosos o dañinos.
¿Qué es la metagenómica?
La metagenómica es el campo de estudio que explora el ácido desoxirribonucleico (ADN). Es más relevante para la comunidad microbiana. Además, es un campo más avanzado en comparación con la genómica. En genómica, se lleva a cabo el análisis del ADN de un organismo en particular. Sin embargo, la metagenómica implica el análisis de material genético en una comunidad de organismos. Así, esto permite estudiar el comportamiento de una comunidad de organismos pertenecientes a una condición o un ambiente.
Figura 01: Metagenómica
La principal técnica involucrada en los estudios de metagenómica es la secuenciación de próxima generación (NGS) que utiliza la tecnología de microarrays. Los métodos NGS pueden analizar múltiples organismos en una sola reacción para determinar la presencia o ausencia de secuencias de ADN específicas. Estas secuencias de ADN pueden ser responsables de una sola enfermedad o de una condición ambiental. Por lo tanto, utilizando el conocimiento metagenómico, la detección de organismos se puede realizar de manera fácil y precisa. La secuenciación durante NGS se lleva a cabo en lecturas cortas y se realiza el perfilado del ADN de los organismos. La secuencia de ADN 16s es una secuencia popular estudiada en la metagenómica de los microorganismos.
Después de la secuenciación de la comunidad de organismos, se debe realizar el alineamiento de las secuencias. Se utilizan herramientas como la Secuencia de alineación local básica (BLAST) para cumplir con la tarea de alineación. Siguiendo la alineación, un árbol filogenético proporciona la relación de cada organismo en la comunidad y detalles sobre su comportamiento.
¿Qué es la metatranscriptómica?
La metatranscriptómica es el campo de estudio que se ocupa del transcriptoma de un organismo. El transcriptoma constituye la totalidad de las secuencias de ARN transcritas durante la transcripción del ADN. Las secuencias de ARNm presentes en el transcriptoma proporcionan información sobre la expresión genética. La metatranscriptómica es el análisis de múltiples transcriptomas en poblaciones o comunidades.
Figura 02: Análisis del transcriptoma
Los estudios de metatranscriptómica también utilizan tecnologías de micromatrices para encontrar las secuencias de las secuencias de lectura corta. Además, la metatranscriptómica también implica un análisis bioinformático exhaustivo utilizando herramientas de alineación y métodos de diseño de árboles. Sin embargo, el campo de la metatranscriptómica es mucho más difícil en comparación con la metagenómica. La extracción de ARNm o ARN en su conjunto no es tan fácil como parece. Dado que el ARN es muy propenso a la destrucción y tiene un tiempo de vida muy corto, el mantenimiento y el almacenamiento de estos podrían ser una posible consulta.
¿Cuáles son las similitudes entre la metagenómica y la metatranscriptómica?
- La metagenómica y la metatranscriptómica son técnicas de alto rendimiento para analizar comunidades de organismos, principalmente comunidades microbianas.
- Ambas técnicas utilizan tecnología de micromatrices para deducir los hallazgos.
- Los resultados obtenidos a menudo se analizan utilizando la alineación BLAST y los árboles filogenéticos.
- Además, ambas técnicas no se centran en un organismo, sino en un grupo o en organismos comunitarios.
- Además, ambos conceptos también se estudian principalmente en relación con los microbios, la razón principal es la diversidad de funciones que desempeñan.
¿Cuál es la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica?
La metagenómica y la metatranscriptómica implican el análisis de la materia genética en una comunidad de organismos. Por lo tanto, la metagenómica se refiere a los patrones y secuencias de ADN, mientras que la metatranscriptómica se refiere al análisis del ARNm o el ADN transcrito. Entonces, esta es la diferencia clave entre la metagenómica y la metatranscriptómica.
Además, el procedimiento de extracción difiere en ambas técnicas; la metagenómica involucra procedimientos de extracción de ADN y la metatranscriptómica involucra procedimientos de extracción de ARN. Por lo tanto, esta también es una diferencia significativa entre la metagenómica y la metatranscriptómica.
La siguiente infografía resume la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica:
Resumen: metagenómica frente a metatranscriptómica
La metagenómica y la metatranscriptómica son nuevos campos de estudio que analizan una comunidad de organismos para una condición particular. Por lo tanto, la metagenómica se refiere al análisis de secuencias de ADN. Por el contrario, la metatranscriptómica se refiere al análisis de secuencias de ARN o productos de ADN transcritos. En este sentido, la metatranscriptómica permite identificar la expresión génica para un caso particular. Ambos son importantes en el análisis de mutaciones y sus efectos. Son técnicas rápidas y más fiables que se utilizan en el diagnóstico avanzado. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica.
