ARNsh vs ARNsi
Durante el proceso de interferencia de ARN (ARNi), la expresión de un gen objetivo se anula con alta especificidad y selectividad. El ARNi es un proceso natural e involucra ARN de interferencia pequeño (ARNip) y ARN de horquilla corta (ARNsh) y ARNsh bifuncional. Actualmente, RNAi se usa ampliamente como una herramienta para la terapia personalizada contra el cáncer. Las aplicaciones de RNAi se realizan básicamente con el siRNA de doble cadena sintetizado químicamente y las moléculas de shRNA basadas en vectores. Aunque estas dos moléculas tienen resultados funcionales similares, difieren en su estructura; por lo tanto, los mecanismos moleculares de acción, las vías de ARN y los efectos fuera del objetivo de estas dos moléculas también difieren.
ARNsh
shRNA es una secuencia de una pequeña molécula de ARN que hace un giro cerrado que se puede usar para silenciar la expresión de un gen objetivo durante la iARN. La expresión de shRNA se logra mediante un vector, que puede ser un virus o una bacteria, o mediante la entrega de plásmidos. Se sintetizan en el núcleo de las células y se transportan al citoplasma para procesos posteriores. Estas moléculas tienen vías de maduración similares a las de miARN; por lo tanto, la síntesis de miRNA ha proporcionado la base para la comprensión de la síntesis de shRNA. Tanto la ARN polimerasa II como la III pueden transcribir ARNhc a través de los promotores de la ARN polimerasa II o III. La ventaja del uso de shRNA es que tienen una tasa de degradación y rotación relativamente baja. La desventaja es que necesita un vector de expresión, lo que puede causar algunos problemas de seguridad.
ARNsi
Los siRNA son moléculas de ARN de doble cadena compuestas de 20 a 25 pares de bases de longitud. Estos se utilizan para la supresión de genes al silenciar cualquier gen con una secuencia de nucleótidos complementaria en la ruta de ARNi. La eliminación de genes por transfección de siRNA a menudo no tiene éxito debido al efecto transitorio; especialmente en células que se dividen rápidamente y la supresión no dura más. Para superar este problema, el siRNA se modifica mediante la introducción de una estructura de horquilla corta. Esta molécula modificada luego se conoce como shRNA. El shRNA debe convertirse en siRNA mediante un Dicer para continuar con su función normal.
¿Cuál es la diferencia entre shRNA y siRNA?
• A diferencia del siRNA, el shRNA tiene una estructura de horquilla adicional. shRNA es una versión modificada de siRNA.
• El shRNA requiere un vector de expresión, mientras que el siRNA no.
• El shRNA se puede usar para la eliminación a largo plazo, mientras que el siRNA se puede usar solo para la eliminación de genes a corto plazo.
• A diferencia de la supresión génica del siRNA, la supresión del shRNA es duradera y, si se inserta a través de un vector viral apropiado, puede producir efectos permanentes de silenciamiento génico.
• Se requiere Dicer para convertir el shRNA nuevamente en una molécula de siRNA para ejecutar sus funciones normales.
