La diferencia clave entre el cianol de xileno y el azul de bromofenol es que en el gel de agarosa al 1 %, el cianol de xileno migra más lentamente, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.
El cianol de xileno y el azul de bromofenol son importantes como marcadores de color que se pueden usar para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida.
¿Qué es el xileno cianol?
El cianol de xileno es un marcador de color electroforético o un tinte de seguimiento. Es útil para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. Cuando esta sustancia se mezcla con la muestra, la concentración de esta sustancia suele ser de alrededor de 0.005% a 0,03%. Algunos sinónimos que podemos usar para xileno cianol incluyen Acid Blue 147, xileno cianol, xileno cianol FF, xileno cianol FF, etc.
La fórmula química de este compuesto es C25H27N2NaO 6S2 La masa molar del xileno cianol es 538,61 g/mol. Esta sustancia puede migrar a una velocidad de aproximadamente 4 a 5 fragmentos de ADN de pares de kilobases en geles de agarosa al 1%. Sin embargo, esto depende del búfer que usemos. Por lo general, el cianol de xileno en gel de poliacrilamida al 6 % puede migrar a una velocidad de fragmentos de ADN de aproximadamente 140 pares de bases. Por otro lado, puede migrar en electroforesis en gel de poliacrilamida desnaturalizante al 20% a razón de 25 bases de oligonucleótidos.
El número de donantes de enlaces de hidrógeno del xileno cianol es de 2 m, y el número de aceptores de enlaces de hidrógeno es 8. El número de enlaces giratorios de este compuesto se puede dar como 7. La complejidad del xileno cianol se puede describir como 1120 grados. Tiene un conteo de estereocentro de enlace definido de 1.
¿Qué es el azul de bromofenol?
El azul de bromofenol es un indicador de pH útil como marcador de color electroforético y colorante. Tiene el nombre químico 3', 3”, 5', 5”-tetrabromofenolsulfonftaleína, BPB. La fórmula química de este compuesto es C19H10Br4O5 S. La masa molar de este compuesto es 669,96 g/mol. Es inodoro y su densidad puede ser de 2,2 g/mL. Su punto de fusión es de 273 grados centígrados y su punto de ebullición es de 279 grados centígrados. Podemos prepararlo añadiendo bromo en exceso a una solución caliente de fenolsulfonftaleína en ácido acético glacial.
El azul de bromofenol es útil como indicador ácido-base en el rango de pH de 3,0 a 4,6. Es capaz de cambiar de amarillo a pH 3.0 a pH 4.6. Además, es una reacción reversible. Estructuralmente, el azul de bromofenol es similar a la fenolftaleína.
Además, podemos usarlo como marcador de color para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. Esta sustancia puede llevar una carga negativa a un pH moderado, donde puede migrar en la misma dirección que el ADN o la proteína en un gel. La tasa de migración puede variar según la densidad del gel y la composición del tampón. Sin embargo, en un gel de agarosa típico al 1 % en tampón TAE o tampón TBE 1 vez, esta sustancia migra a la misma velocidad que un fragmento de ADN de unos 300 pares de bases.
¿Cuál es la diferencia entre el cianol de xileno y el azul de bromofenol?
El cianol de xileno y el azul de bromofenol son marcadores de color importantes. La diferencia clave entre el cianol de xileno y el azul de bromofenol es que, en el gel de agarosa al 1 %, el cianol de xileno migra más lentamente, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.
A continuación se muestra un resumen de la diferencia entre el cianol de xileno y el azul de bromofenol en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen: xileno cianol frente a azul de bromofenol
El cianol de xileno y el azul de bromofenol son importantes como marcadores de color utilizados en el control del proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. La diferencia clave entre el cianol de xileno y el azul de bromofenol es que, en el gel de agarosa al 1 %, el cianol de xileno migra más lentamente, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.
