La diferencia clave entre la elaboración de perfiles de polisomas y la elaboración de perfiles de ribosomas es que la elaboración de perfiles de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que la elaboración de perfiles de ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas solo usando la secuencia de ARNm durante la traducción.
La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas que convierte la información del ARNm en una secuencia de aminoácidos. Translatomics es un estudio de ORF (marcos abiertos de lectura) que se traducen activamente en una célula de un organismo. Las técnicas de perfilado de polisomas y ribosomas son dos tipos de técnicas en el campo de la biología molecular para evaluar e inferir diferentes parámetros en el contexto del análisis del translatoma.
¿Qué es el perfilado de polisomas?
La elaboración de perfiles de polisomas es una técnica que infiere el estado de la traducción de un ARNm específico mediante el análisis del comportamiento tanto del ribosoma como del ARNm (polisoma). En otras palabras, esta técnica proporciona datos y conclusiones sobre la asociación de mRNAs con ribosomas. El polisoma se refiere al grupo de ribosomas unidos a un ARNm que está presente durante la fase de elongación de la traducción.
Figura 01: Perfilado de polisomas
El perfilado de polisomas requiere el lisado celular, que luego se centrifuga. Luego, la muestra centrifugada se separa en función de sus densidades para caracterizar las subunidades pequeñas y grandes de los ribosomas y el ARNm correspondiente involucrado en la formación del polisoma. Además, el proceso también implica medir la densidad óptica. Se requieren expertos para realizar perfiles de polisomas.
La técnica de perfilado de polisomas es una herramienta importante para muchas aplicaciones. Los científicos usan esta técnica para estudiar el grado de traducción en las células. Más específicamente, es una herramienta para proporcionar información precisa sobre el estudio de proteínas individuales y sus ARNm específicos. En el contexto del estudio del grado de traducción de un ARNm en particular, la técnica de perfilado de polisomas es vital. Aquí, las secuencias 3' y 5' de un ARNm se pueden investigar con referencia a sus efectos sobre la cantidad de ARNm producido y el nivel de traducción.
¿Qué es el perfilado de ribosomas?
El perfilado de ribosomas es una técnica que analiza el comportamiento del ribosoma con respecto a su ARNm durante la traducción. Esta técnica fue encontrada y desarrollada por Joan Steitz y Marilyn Kozak. Más tarde, esta tecnología fue desarrollada por dos científicos, Nicholas y Jonathan, en combinación con la secuenciación de próxima generación, lo que condujo al desarrollo de diferentes técnicas relacionadas, como la metodología Traducir la purificación por afinidad de ribosomas (TRAP).
Figura 02: Secuenciación de ribosomas
El procedimiento de perfilado de ribosomas implica aislar el ARNm, eliminar el ARN que no está unido a los ribosomas y separar el ARNm unido a los ribosomas. Siguiendo este procedimiento, el aislado de ARNm se transcribe de forma inversa y tiene lugar la síntesis de ADNc. Finalmente, los datos de la secuencia se pueden alinear con el perfil de traducción para deducir las características del comportamiento de los ribosomas con respecto al ARNm.
El perfilado de ribosomas ayuda a muchos investigadores a identificar e inferir la ubicación de los sitios de inicio de la traducción, el complemento de los marcos de lectura abiertos (ORF) traducidos en una célula o tejido, la distribución de los ribosomas en el ARNm y la tasa de ribosomas traductores. El perfilado de ribosomas también se conoce como huella de ribosomas o Ribo Seq.
¿Cuáles son las similitudes entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas?
- La elaboración de perfiles de polisomas y ribosomas son técnicas de biología molecular importantes en la investigación.
- Proporcionan información sobre el proceso de traducción.
- Ambos procesos de creación de perfiles proporcionan datos a través del análisis del traductor.
- Se necesitan expertos profesionales para realizar ambas técnicas para obtener resultados precisos.
- Las herramientas bioinformáticas juegan un papel importante en ambas técnicas.
¿Cuál es la diferencia entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas?
La elaboración de perfiles de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas utilizando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que la elaboración de perfiles de ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas utilizando únicamente la secuencia de ARNm durante la traducción. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas. Además, el perfilado de polisomas implica técnicas como la centrifugación en gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica, mientras que el perfilado de ribosomas implica técnicas de extracción y secuenciación de ARNm. Además, el perfilado de ribosomas es más preciso que el perfilado de polisomas.
La siguiente infografía presenta las diferencias entre los perfiles de polisomas y ribosomas en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen: perfilado de polisomas frente a perfilado de ribosomas
La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas que consiste en convertir la información de la secuencia de ARNm en una secuencia de aminoácidos. Este proceso requiere una plantilla de ARNm, ribosomas, aminoácidos, ARNt y otros factores. El perfilado de polisomas y ribosomas son dos técnicas moleculares. El perfilado de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfilado de los ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando solo la secuencia de ARNm durante la traducción. El perfilado de polisomas implica técnicas como la centrifugación en gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica. El perfilado de ribosomas implica técnicas como la extracción de ARNm, la síntesis de ADNc y la secuenciación. Entonces, esto resume la diferencia entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas.
