La diferencia clave entre los retrotransposones LTR y no LTR es que los retrotransposones LTR son un tipo de retrotransposones que tienen largas repeticiones terminales en su estructura, mientras que los retrotransposones no LTR son un tipo de retrotransposones que no tienen largas repeticiones terminales en su estructura.
Los retrotransposones (elementos transponibles de clase I o transposones a través de intermediarios de ARN) son un tipo de componente genético que puede copiarse y pegarse a sí mismo en diferentes ubicaciones genómicas. Realizan esto convirtiendo el ARN nuevamente en ADN a través de un proceso llamado transcripción inversa utilizando un intermediario de transposición de ARN. Hay dos tipos principales de retrotransposones como retrotransposones LTR y no LTR
¿Qué son los retrotransposones LTR?
Los retrotransposones LTR son un tipo de retrotransposones que tienen largas repeticiones terminales en su estructura. Se pueden encontrar cadenas largas de ADN repetitivo en cada extremo de un retrotransposón LTR. Estos se conocen como repeticiones terminales largas (LTR). Cada LTR tiene una longitud de unos pocos cientos de pares de bases. Los retrotransposones LTR suelen tener más de 5 kilobases de largo. Además, entre las repeticiones terminales largas, hay genes que se pueden transcribir equivalentes a los genes gag y pol de los retrovirus. Estos genes se superponen de modo que codifican una proteasa que normalmente procesa la transcripción resultante en productos genéticos funcionales.
Figura 01: Retrotransposones LTR
El gen Gag de los retrotransposones produce un producto que se asocia con otras transcripciones de retrotransposones para formar partículas similares a virus. El gen Pol produce productos que incluyen enzimas como dominios de transcriptasa inversa, integrasa y ribonucleasa H. La enzima transcriptasa inversa lleva a cabo la transcripción inversa del ADN retrotransposón. La enzima integrasa integra el ADN del retrotransposón en el ADN del genoma eucariótico. Los dominios de ribonucleasa H son útiles para romper los enlaces fosfodiéster entre los intermediarios de ARN. Los retrotransposones LTR también codifican transcritos con sitios de unión de ARNt para que puedan experimentar una transcripción inversa con bastante facilidad. Además, dado que el retrotransposón contiene información del genoma eucariota, puede insertar copias de sí mismo en otras ubicaciones genómicas dentro de una célula eucariota.
¿Qué son los retrotransposones no LTR?
Los retrotransposones no LTR son un tipo de retrotransposones que no tienen repeticiones terminales largas en su estructura. Al igual que los retrotransposones LTR, los retrotransposones que no son LTR también contienen genes para dominios de transcriptasa inversa, proteína de unión a ARN, nucleasa y, a veces, ribonucleasa H. Pero carecen de las largas repeticiones terminales; en cambio, tienen repeticiones cortas que pueden tener un orden invertido de bases una al lado de la otra. Las proteínas de unión al ARN se unen al intermediario de transposición de ARN y las nucleasas rompen los enlaces fosfodiéster entre los nucleótidos de los ácidos nucleicos.
Figura 02: Retrotransposones LTR y no LTR
Aunque son retrotransposones, no pueden realizar la transcripción inversa utilizando un intermediario de ARN de la misma manera que los retrotransposones LTR. Esto se debe a que los retrotransposones que no son LTR no contienen secuencias que se unan al ARNt. Por lo tanto, un retrotransposón no LTR transcrito en ARNm y traducido en proteínas actúa como transcriptasa inversa. La transcriptasa inversa hace una copia de ADN del ARN del retrotransposón no LTR que se puede integrar en el genoma en un nuevo sitio. Además, los retrotransposones que no son LTR se dividen en dos tipos: LINE (elementos nucleares intercalados largos) y SINE (elementos nucleares intercalados cortos).
¿Cuáles son las similitudes entre los retrotransposones LTR y no LTR?
- Los retrotransposones LTR y no LTR son los dos tipos principales de retrotransposones.
- Ambos tipos contienen genes para enzimas como la transcriptasa inversa, la proteína de unión al ARN, la nucleasa y los dominios H de la ribonucleasa.
- Se pueden encontrar en el genoma humano.
- Ambos tipos son importantes desde el punto de vista evolutivo.
¿Cuál es la diferencia entre retrotransposones LTR y no LTR?
Los retrotransposones LTR tienen repeticiones terminales largas en su estructura, mientras que los retrotransposones que no son LTR carecen de repeticiones terminales largas en su estructura. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre los retrotransposones LTR y no LTR. Además, los retrotransposones LTR tienen repeticiones directas largas que son solo una secuencia de bases que se repiten. Por otro lado, los retrotransposones que no son LTR tienen repeticiones cortas que pueden tener un orden invertido de bases una al lado de la otra.
La siguiente infografía presenta las diferencias entre los retrotransposones LTR y no LTR en forma tabular para compararlos lado a lado.
Resumen: retrotransposones LTR frente a no LTR
Los retrotransposones LTR y no LTR son los dos tipos principales de retrotransposones. Los retrotransposones LTR tienen repeticiones terminales largas en su estructura, mientras que los retrotransposones que no son LTR no tienen repeticiones terminales largas en su estructura. Entonces, esta es la diferencia clave entre los retrotransposones LTR y no LTR.
