La diferencia clave entre CDS y ORF es que CDS es la secuencia de nucleótidos real de un gen que se traduce en una proteína, mientras que ORF es un tramo de secuencia de ADN que comienza con el sitio de inicio de la traducción (codón de inicio) y termina con un sitio de terminación de la traducción (codón de terminación).
Un gen tiene una secuencia codificante (CDS). Consiste en los exones totales del gen y un codón de inicio y un codón de terminación. Es la parte real del gen que traduce y produce la proteína. El marco de lectura abierto u ORF es una secuencia de nucleótidos ubicada entre un codón de inicio y un codón de terminación. No hay un codón de parada dentro de un ORF que interrumpa el código genético que se traduce en una proteína. En procariotas, CDS y ORF de un gen son lo mismo.
¿Qué es CDS?
CDS o secuencia de codificación es la parte del gen que realmente se traduce en una proteína. Se compone de exones y dos codones conocidos como codón AUG y codón de parada. CDS no contiene dos regiones sin traducir: 5' UTR y 3 UTR. Además, los intrones no están incluidos en CDS.
Figura 01: Secuencia de codificación
En comparación con el genoma completo de un individuo, las secuencias de codificación son una pequeña fracción. La secuencia codificante consiste en la secuencia de nucleótidos necesaria para formar la secuencia de aminoácidos de la proteína. Por lo tanto, los CDS son exones concentrados que se pueden dividir en codones o tripletes de nucleótidos. Los codones dan origen a los aminoácidos.
¿Qué es un ORF?
El marco de lectura abierto u ORF es el tramo continuo de una secuencia de nucleótidos que comienza con un codón de inicio y termina con un codón de terminación. En palabras simples, ORF se refiere a la región de la secuencia de nucleótidos ubicada entre los codones de inicio y finalización. En el medio, no hay un codón de terminación que interrumpa el ORF. La secuencia de nucleótidos entre el codón de inicio y finalización codifica para los aminoácidos. En general, el codón de inicio es ATG, mientras que los codones de terminación son TAG, TAA y TGA. ORF da una proteína funcional cuando se transcribe y traduce. Por lo tanto, ORF incluye un codón de inicio, varios codones en la región media y un codón de terminación. Curiosamente, ORF tiene una longitud que se puede dividir por tres.
Figura 02: Marco de lectura abierto
En los procariotas, dado que no hay intrones, ORF es la secuencia de codificación de un gen que se transcribe directamente en ARNm. Por lo tanto, CDS y PRF son los mismos en procariotas. Al buscar genes en procariotas, es fácil detectar un ORF y encontrar un gen en procariotas. En eucariotas, dado que hay intrones, ORF es la secuencia de codones que se forma después del procesamiento o empalme de ARN. El ORF es una prueba que ayuda a la predicción de genes, ya que es probable que el ORF forme parte de un gen.
¿Cuáles son las similitudes entre CDS y ORF?
- En procariotas, CDS y ORF son lo mismo.
- Ambos tienen codón de inicio y codón de terminación.
- Tienen un número de nucleótidos que se puede dividir por tres.
- Una vez que se traducen, producen secuencias de aminoácidos.
¿Cuál es la diferencia entre CDS y ORF?
CDS es la parte real del gen que se traduce en una proteína, mientras que ORF es el tramo de ADN entre un codón de inicio y un codón de terminación. Entonces, esta es la diferencia clave entre CDS y ORF. Además, CDS no contiene intrones, pero ORF puede contener intrones. CDS se transcribe completamente en una secuencia de ARNm completa, mientras que ORF puede ser parte de la secuencia de ARNm. Por lo tanto, esta es otra diferencia entre CDS y ORF.
La siguiente infografía tabula lado a lado las diferencias entre CDS y ORF.
Resumen: CDS frente a ORF
CDS y ORF son dos partes importantes de un gen. CDS se refiere a la región real de ADN que se traduce en una proteína. ORF es una secuencia de ADN que comienza con el codón de inicio "ATG" y termina con cualquiera de los tres codones de terminación (TAA, TAG o TGA). ORF puede ser una parte del ARNm completo de un gen. Sin embargo, la secuencia de codificación de un gen se transcribe para completar la secuencia de ARNm. Todos los CDS son ORF. Pero no todos los ORF son CDS. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre CDS y ORF.
