La diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica que se usa para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables.
Los términos acoplamiento molecular y puntuación se utilizan en el campo del modelado molecular. El modelado molecular es una técnica utilizada para determinar los posibles arreglos de diferentes moléculas en una sustancia dada. Esta técnica es importante para crear nuevos compuestos estables.
¿Qué es el acoplamiento molecular?
El acoplamiento molecular es una simulación computacional de la unión de un ligando candidato a un receptor. Este método predice la orientación preferida de una molécula a otra molécula cuando se unen entre sí para formar un complejo estable. Los resultados obtenidos con esta técnica se pueden utilizar para predecir la fuerza de asociación o la afinidad de unión entre dos moléculas. Aquí, la función de puntuación molecular también es importante.
Figura 01: Un diagrama simple que muestra el proceso de interacciones moleculares en sistemas biológicos
En general, esta técnica considera las moléculas biológicamente relevantes, como proteínas, péptidos, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos. Estas moléculas son muy importantes y juegan un papel importante en los mecanismos de transducción de señales en nuestro cuerpo. Por lo tanto, la orientación de las dos moléculas que se van a unir para este proceso de transducción de señales afecta el tipo de señal que aquí se produce. Eso significa; El acoplamiento molecular es importante para determinar tanto la fuerza como el tipo de señal producida durante la transducción de señales en los sistemas biológicos.
Además, las técnicas de acoplamiento molecular son importantes en el diseño de fármacos basados en estructuras. Esto se debe a la previsibilidad de la conformación de unión de moléculas pequeñas, como ligandos, a un sitio de unión adecuado.
¿Qué es la puntuación molecular?
La puntuación molecular es un tipo de función matemática que es útil para evaluar el progreso del acoplamiento molecular. En el campo de la química computacional, las funciones de puntuación se utilizan para predecir la afinidad de unión entre dos moléculas después del proceso de acoplamiento. Por ejemplo, si tenemos una molécula pequeña de un fármaco en partículas y hay un objetivo biológico como una proteína, podemos evaluar la afinidad del fármaco hacia el sitio de unión. Además, la puntuación molecular se puede utilizar para predecir las interacciones intermoleculares entre dos proteínas o entre una proteína y moléculas de ADN.
Figura 02: Función de puntuación en resumen
La principal aplicación de la puntuación molecular se encuentra en los procesos de diseño de fármacos, por ejemplo, detección virtual, diseño de novo, optimización de prospectos, etc.
¿Cuál es la diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación?
El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. los diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables.
La siguiente infografía resume la diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación.
Resumen: acoplamiento molecular frente a puntuación
El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. los diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables.
