La diferencia clave entre la PCR de consenso y la PCR pan es que la PCR de consenso siempre se dirige a regiones conservadas, mientras que la PCR pan se dirige a regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una técnica de amplificación de genes que consta de tres pasos principales como desnaturalización, hibridación y extensión. Esto es ampliamente utilizado en diagnóstico e identificación molecular. Las técnicas Consensus PCR y Pan PCR se basan en los objetivos de los cebadores que utiliza cada tipo de PCR.
¿Qué es la PCR de consenso?
La PCR de consenso es una técnica de PCR que se dirige a una región conservada para una especie o género en particular. Por lo tanto, se eligen regiones altamente conservadas para la amplificación. A través de este método, los organismos pueden identificarse y distinguirse en función de su consenso. Este método identifica una región conservada para una especie en particular. Por ejemplo, la región de ARNr 16s de las bacterias sigue siendo una región conservada entre las bacterias. Por lo tanto, solo se requiere un conjunto de cebadores para la amplificación. En la mayoría de los casos, se puede utilizar un cebador universal específico para la región conservada.
Figura 01: Técnica PCR
Al seguir un método PCR de consenso, se pueden deducir la caracterización de las especies y las relaciones evolutivas. En función de la eficiencia de amplificación del organismo de muestra en particular, también se puede deducir el consenso del organismo hacia el grupo. Además, la realización de una PCR de consenso es vital en los estudios filogenéticos. Permite la identificación de una especie e interpreta la desviación que muestra el organismo particular en términos del ancestro común.
¿Qué es Pan PCR?
A Pan PCR es un modo de multiplexación de PCR. En esta técnica, se amplifican diferentes cepas usando varios objetivos de cebadores. Los objetivos, sin embargo, pueden ser objetivos comunes para los grupos de cepas. Por lo tanto, en Pan PCR, se pueden usar más de dos conjuntos de cebadores a la vez. Puede tener lugar en un método de reacción de un solo tubo o como un método de reacción de múltiples tubos. Pan PCR requiere más tiempo y es más complejo en comparación con una PCR de consenso. Por este motivo, la interpretación de los resultados de la PCR también puede ser más compleja en Pan PCR.
La principal aplicación de Pan PCR es el diagnóstico molecular. Permite distinguir entre diferentes cepas de una especie mediante la amplificación del objetivo. Pan PCR es una técnica ideal para identificar diferentes cepas de una sola especie que causan una enfermedad. En la mayoría de los casos, la automatización de las técnicas Pan PCR para diversas condiciones de salud es muy importante y es una técnica confiable y altamente eficiente.
¿Cuáles son las similitudes entre Consensus PCR y Pan PCR?
- Consensus PCR y Pan PCR son dos tipos de técnicas de PCR.
- Ambos procedimientos siguen el procedimiento general de tres pasos: desnaturalización, recocido y extensión.
- Utilizan cebadores que son específicos del objetivo.
- Ambas reacciones tienen lugar en un termociclador.
- Estas reacciones se pueden automatizar.
- Ambos pueden usarse en diagnóstico e identificación molecular; sin embargo, la precisión varía.
- Estos procedimientos requieren validación.
¿Cuál es la diferencia entre Consensus PCR y Pan PCR?
Tanto Consensus como Pan PCR siguen el mismo procedimiento de rutina. Sin embargo, la diferencia clave entre la PCR de consenso y la PCR Pan se basa en los objetivos del cebador que utiliza cada procedimiento. Mientras que la PCR de consenso siempre se enfoca en regiones conservadas, una Pan PCR se enfoca en regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo. Debido a esta diferencia, los protocolos de diseño de cebadores, la cantidad de juegos de cebadores utilizados y las aplicaciones específicas varían.
La siguiente infografía resume la diferencia entre Consensus PCR y Pan PCR.
Resumen: PCR de consenso frente a PCR pan
PCR, presentado por Mulli, juega un importante papel revolucionario en las aplicaciones de biología molecular. Consensus y Pan PCR son dos tipos de PCR basados en las regiones de destino de sus cebadores. Mientras que la PCR de consenso se dirige a regiones conservadas, Pan PCR se dirige a regiones variables y desempeña un papel importante en la identificación de cepas. Debido a esta diferencia básica entre PCR consenso y Pan PCR, las funciones específicas de cada tipo de PCR también varían desde el análisis filogenético hasta la caracterización molecular y el diagnóstico molecular.
