Diferencia entre la ligadura del extremo romo y adhesivo

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Diferencia entre la ligadura del extremo romo y adhesivo
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Video: Diferencia entre la ligadura del extremo romo y adhesivo

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Anonim

Diferencia clave: ligadura roma frente a extremo pegajoso

Las endonucleasas de restricción son enzimas específicas que cortan el ADN de doble cadena (dsDNA). También se conocen como tijeras moleculares en biología molecular. Las enzimas de restricción pueden reconocer secuencias cortas específicas del dsDNA conocidas como sitios de reconocimiento y escindir enlaces fosfodiéster e hidrógeno para abrir cadenas dobles. Como resultado de la escisión de estas enzimas, se producen fragmentos de ADN con diferentes tipos de extremos, como extremos adhesivos y extremos romos. La ADN ligasa es una enzima utilizada en biología molecular para unir dos hebras adyacentes de ADN mediante la formación de nuevos enlaces. El paso se conoce como ligadura y, según el tipo de extremo del ADN ligado, se puede denominar ligadura de extremos romos y ligadura de extremos pegajosos. La diferencia clave entre la ligadura de extremos romos y pegajosos es que la ligadura de extremos romos ocurre entre fragmentos de ADN que contienen dos extremos romos, mientras que la ligadura de extremos pegajosos ocurre entre voladizos de 5 'y 3'. En comparación con la ligadura del extremo romo, la ligadura del extremo pegajoso es más eficiente y estable.

¿Qué es una ligadura de extremo romo?

Algunas endonucleasas de restricción pueden cortar el ADN en las bases opuestas y producir fragmentos de ADN de extremos romos. Estas enzimas se conocen como cortadores de extremos romos; se escinden directamente hacia abajo hasta la mitad del sitio de restricción sin dejar bases sobresalientes monocatenarias. Los extremos romos también se conocen como extremos no sobresalientes, ya que no tienen bases sobresalientes de 3' y 5' en los extremos. Ambas hebras terminan a partir de pares de bases en extremos romos. Las enzimas comunes de corte de extremos romos son EcoRV HaeIII, AluI y SmaI.

La ligadura del extremo romo se realiza entre dos extremos romos. No es una ligadura de bases protuberantes. Esta ligadura es menos eficiente que la ligadura del extremo pegajoso. Sin embargo, en algunas ocasiones, la ligadura de extremos romos se vuelve más ventajosa que la ligadura de extremos pegajosos, especialmente cuando se ligan productos de PCR. Los productos de PCR siempre se fabrican con extremos romos. La ligadura de extremos romos no requiere extremos complementarios en el ADN para la ligadura.

Diferencia entre la ligadura del extremo romo y pegajoso
Diferencia entre la ligadura del extremo romo y pegajoso

Figura 01: Producción de extremos romos por la enzima Eco RV

¿Qué es una ligadura del extremo adhesivo?

Algunas endonucleasas de restricción pueden cortar el dsDNA, dejando una pieza sobresaliente de ADN monocatenario al final. Estos extremos se conocen como extremos pegajosos o sobresalientes. La ligadura de extremos cohesivos ocurre entre dos fragmentos de ADN que contienen salientes correspondientes porque los extremos cohesivos poseen bases no apareadas y requieren bases complementarias para formar enlaces. Por lo tanto, es necesario utilizar la misma enzima de restricción para ambas fuentes de ADN para producir los fragmentos de ligadura correspondientes.

La ligadura de extremos pegajosos es más eficaz y suele ser muy deseable en los procesos de clonación. Hay varias enzimas de restricción que producen extremos cohesivos. Son EcoRI, BamHI, HindIII, etc.

Diferencia clave: ligadura de extremos romos y pegajosos
Diferencia clave: ligadura de extremos romos y pegajosos

Figura 02: Producción de extremos pegajosos por la enzima Eco RI

¿Cuál es la diferencia entre la ligadura del extremo romo y adhesivo?

Ligadura roma vs extremo pegajoso

La ligadura de extremos romos se produce entre dos fragmentos de ADN de extremos romos. La ligadura del extremo adhesivo se produce entre dos fragmentos de ADN coincidentes con extremos adhesivos.
Enzimas
Los cortadores de extremos romos producen extremos romos. Los cortadores de extremos adhesivos producen extremos adhesivos o cohesivos.
Requisito de extremos coincidentes
No requiere fragmentos coincidentes ni bases complementarias. Requiere bases complementarias en los extremos para formar pares de bases.
Eficiencia
Es menos eficaz que la ligadura del extremo adherente Es más eficiente que la ligadura de extremo romo.

Resumen: ligadura roma frente a extremo pegajoso

Las endonucleasas de restricción pueden escindir el dsDNA y producir fragmentos de ADN con diferentes extremos. Reconocen secuencias específicas y restringen el ADN creando extremos pegajosos y romos. Los extremos adhesivos tienen bases desapareadas al final de los fragmentos. Los extremos romos se crean debido a un escote recto y tienen pares de bases en los extremos. La ligadura del extremo pegajoso requiere dos piezas complementarias de ADN monocatenario. La ligadura de extremos romos se produce entre dos fragmentos de extremos romos cualesquiera. Esta es la diferencia entre la ligadura roma y pegajosa.

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