La diferencia clave entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice es que hélice-bucle-hélice media en la dimerización de proteínas, mientras que hélice-giro-hélice regula la expresión génica a través de la unión al ADN.
Un motivo de proteína es una secuencia de conservación breve asociada con distintas funciones del ADN. Se asocia principalmente con un sitio estructural especial con una función química o biológica única. Estos motivos contienen pequeñas regiones de estructuras tridimensionales de aminoácidos con diferentes moléculas de proteína. Por lo general, los motivos individuales contienen solo unos pocos elementos. Helix-loop-helix y helix-turn-helix contienen tres elementos. Sus motivos estructurales de proteínas incluyen bucles con diferentes longitudes y estructuras no especificadas.
¿Qué es Helix-Loop-Helix?
A helix-loop-helix (HLH) es un motivo estructural de proteína que define una de las familias más grandes de factores de transcripción dimerizantes. Estos factores de transcripción contienen residuos de aminoácidos para facilitar el mecanismo de unión al ADN y son diméricos. El motivo estructural de la proteína contiene dos hélices α y están conectadas por un bucle. Una hélice parece más pequeña de las dos hélices, y la flexibilidad del bucle permite la dimerización empaquetándose y plegándose contra otra hélice. La hélice que parece más grande suele contener regiones de unión al ADN. Las proteínas HLH se unen a una secuencia de consenso que se conoce como E-box. Una secuencia consenso es un orden calculado que contiene residuos de nucleótidos o aminoácidos. E-box es un elemento que responde al ADN en algunos eucariotas que actúa como un sitio de unión a proteínas y regula la expresión génica.
Figura 01: motivo Helix-loop-helix
Los factores de transcripción HLH son esenciales para el desarrollo y la actividad celular. Las proteínas HLH pertenecen principalmente a seis grupos, que se indican con las letras A a la F. Los factores de transcripción incluidos en cada grupo son:
Grupo A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD y neurogeninas, grupo B: MAX, C-Myc, N-Myc y TCF4
Grupo C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3 y MOP5
Grupo D; CEM
Grupo E: HEY1 y HEY2
Grupo F: EBF1
Dado que la mayoría de los factores de transcripción de HLH son heterodiméricos, la dimerización a menudo los regula.
¿Qué es Helix-Turn-Helix?
Hélice-giro-hélice (HTH) es un motivo estructural de proteína que es capaz de unirse al ADN. Cada monómero está organizado con dos hélices α y está unido por una cadena corta de aminoácidos. Esto se une a un surco en la hélice del ADN. Los motivos HTH suelen regular la expresión génica. El reconocimiento de HTH y la unión al ADN se llevan a cabo mediante dos hélices α. Una hélice ocupa el extremo N-terminal mientras que la otra está en el C-terminal. En la mayoría de los escenarios, la hélice lleva a cabo el reconocimiento del ADN. Por lo tanto, se conoce como la hélice de reconocimiento. La unión al surco en el ADN tiene lugar a través de una serie de interacciones de Van der Waals y enlaces de hidrógeno con las bases expuestas. La otra hélice α estabiliza la interacción entre la proteína y el ADN y no juega un papel importante en el reconocimiento. Sin embargo, la hélice de reconocimiento y la hélice restante tienen una orientación similar.
Figura 02: Hélice-giro-hélice de la familia TetR
El HTH se clasifica según la estructura y disposición espacial de las hélices. Los tipos principales son HTH di-helicoidal, tri-helicoidal, tetra-helicoidal y alada. El tipo di-helicoidal es el tipo más simple con dos hélices y un dominio de proteína plegable independiente. El tipo tri-helicoidal se encuentra en el activador transcripcional Myb. El tipo tetrahelicoidal tiene una hélice C-terminal adicional. Finalmente, el HTH alado está formado por un haz de 3 hélices y una lámina beta de 3 o 4 hebras.
¿Cuáles son las similitudes entre Helix-Loop-Helix y Helix-Turn-Helix?
- Helix-loop-helix y helix-turn-helix son motivos estructurales de proteínas.
- Ambos contienen un denominador común en factores de transcripción basales y específicos.
- Están presentes en eucariotas.
¿Cuál es la diferencia entre Helix-Loop-Helix y Helix-Turn-Helix?
Hélice-bucle-hélice media la dimerización de proteínas, mientras que hélice-giro-hélice regula la expresión génica a través de la unión al ADN. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice. Además, HLH contiene ciertos protooncogenes y genes implicados en la diferenciación que codifican factores de transcripción, mientras que HTH contiene muchos genes homeóticos que codifican factores de transcripción. Además, hélice-bucle-hélice consiste principalmente en alfa-hélices unidas por un bucle, mientras que hélice-giro-hélice consiste principalmente en bucles unidos por un soporte de aminoácido corto que forma un surco.
La siguiente infografía presenta las diferencias entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen – Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
Un motivo de proteína es una secuencia de conservación breve asociada con distintas funciones del ADN. Helix-loop-helix y helix-turn-helix son dos tipos de motivos estructurales de proteínas. La diferencia clave entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice es que hélice-bucle-hélice media la dimerización de proteínas, mientras que hélice-giro-hélice regula la expresión génica a través de la unión al ADN. HLH es un motivo estructural de proteína que define una de las familias más grandes de factores de transcripción dimerizantes. El motivo estructural de la proteína contiene dos hélices α y están conectadas por un bucle. HTH es un motivo estructural de proteína que es capaz de unirse al ADN. Cada monómero está organizado con dos hélices α y está unido por una hebra de aminoácido corta y se une a un surco en la hélice de ADN. Entonces, esto resume la diferencia entre helix-loop-helix y helix-turn-helix.
