La diferencia clave entre la secuencia de Shine Dalgarno y la de Kozak es que la secuencia de Shine Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en el ARN mensajero bacteriano y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos.
Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak son dos secuencias de consenso que son muy importantes para el inicio de la traducción. En biología molecular, la traducción es el proceso por el cual los ribosomas en el citoplasma sintetizan proteínas después del proceso de transcripción. En la traducción, un ARNm (ARN mensajero) se decodifica en un ribosoma para producir una cadena de aminoácidos específica fuera del núcleo. Por lo general, un ribosoma induce el proceso de decodificación al facilitar la unión de secuencias de anticodón de ARNt complementarias a codones de ARNm. La traducción procede en tres etapas: iniciación, elongación y terminación.
¿Qué es Shine Dalgarno Sequence?
La secuencia de Shine Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en el ARN mensajero bacteriano y arqueal. Generalmente se encuentra alrededor de 8 bases aguas arriba del codón de inicio AUG. Esta secuencia de ARN ayuda a reclutar ribosomas para el ARN mensajero al alinear el ribosoma con un codón de inicio de ARNm. Por lo tanto, inicia la síntesis de proteínas. Una vez después del reclutamiento, el tRNA puede agregar aminoácidos en la secuencia dictada por los codones del mRNA. Esta secuencia especial es común en las bacterias pero más rara en las arqueas. Además, también está presente en los transcritos de cloroplastos y mitocondrias. La secuencia Shine Dalgarno fue propuesta por primera vez por los científicos australianos John Shine y Lynn Dalgarno. La secuencia consenso de seis bases es AGGAGG. Por ejemplo, en Escherichia coli la secuencia es AGGAGGU.
Figura 01: Secuencia de Shine Dalgarno
La selección del sitio de iniciación (AUG) depende de la interacción entre la subunidad 30S del ribosoma y la plantilla de ARNm. La región rica en pirimidina en el componente 16srRNA de la subunidad 30S se une a la región rica en purina conocida como secuencia Shine Dalgarno cadena arriba del codón de iniciación AUG en el ARNm. Además, durante la formación del complejo de iniciación, estas secuencias de nucleótidos complementarias se emparejan para formar una estructura de ARN de doble cadena. Esto facilita la unión del ARNm a un ribosoma de tal manera que el codón de iniciación se coloca en el sitio P del ribosoma.
¿Qué es la secuencia Kozak?
La secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARNm eucarióticos. Esta secuencia también se denomina secuencia consenso de Kozak. La secuencia de Kozak es la secuencia óptima para iniciar la traducción en eucariotas. Esta secuencia es un aspecto integral de la regulación de proteínas. También es muy importante para la salud celular en general. Ayuda a corregir la traducción de proteínas a partir de mensajes genéticos al mediar en el ensamblaje de los ribosomas y el inicio de la traducción.
Figura 02: Secuencia Kozak
Esta secuencia lleva el nombre de la científica que la descubrió, Marilyn Kozak. Lo descubrió a través de un análisis detallado de secuencias genómicas de ADN. La secuencia de Kozak es 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Las letras mayúsculas indican bases conservadas, mientras que las letras minúsculas indican bases variables comunes. R indica una purina (adenina o guanina) que siempre se coloca en esta ubicación.
¿Cuáles son las similitudes entre Shine Dalgarno y Kozak Sequence?
- Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak son dos secuencias de consenso que son muy importantes en el inicio de la traducción.
- Ambas son secuencias de ARN.
- La subunidad más pequeña del ribosoma se une a ambas secuencias.
- Ambas secuencias median en el ensamblaje adecuado de ribosomas y el inicio de la traducción.
- Son aspectos integrales de la regulación de proteínas y la salud celular en general.
¿Cuál es la diferencia entre Shine Dalgarno y Kozak Sequence?
La secuencia de Shine Dalgarno es un sitio de unión ribosómico que se encuentra en el ARN mensajero bacteriano y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas que se encuentra en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos. Entonces, esta es la diferencia clave entre Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak. Además, la secuencia de Shine Dalgarno es 5'AGGAGGU3' mientras que la secuencia de Kozak es 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre las secuencias de Shine Dalgarno y Kozak en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen – Shine Dalgarno vs Kozak Secuencia
Las secuencias de Shine Dalgarno y Kozak son dos secuencias de ARN consenso que son muy importantes para el ensamblaje de los ribosomas y el inicio de la traducción. La secuencia de Shine Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en el ARN mensajero bacteriano y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak.
