La diferencia clave entre las sondas de ADN y ARN es que las sondas de ADN son fragmentos de ADN que son complementarios a las secuencias de nucleótidos diana, mientras que las sondas de ARN son tramos de ARN monocatenario que son secuencias de ácido nucleico complementarias de las secuencias diana.
Una sonda es una secuencia corta de ADN o ARN sintetizada artificialmente que podría marcarse radiactivamente o con moléculas no radiactivas. Puede tener una longitud de 100 a 1000 bases. Las sondas son útiles para detectar secuencias de nucleótidos diana que son complementarias a la secuencia de la sonda. Una vez añadidas, las sondas se hibridan con las secuencias complementarias o las secuencias diana y se hacen visibles para identificar las secuencias diana ya que lleva radiactividad. Las sondas son herramientas moleculares importantes en muchas áreas microbianas y moleculares, como la detección de enfermedades genéticas, en virología, en patología forense, en pruebas de paternidad, en huellas dactilares de ADN, RFLP, citogenética molecular, hibridación in situ, etc.
¿Qué son las sondas de ADN?
Las sondas de ADN son tramos de ADN monocatenarios. Pueden usarse para detectar la presencia de secuencias de ácido nucleico complementarias (secuencias diana) por hibridación. Una vez que una sonda de ADN hibridó con su secuencia complementaria, forma un híbrido de doble cadena. Para detectarlos, las sondas de ADN generalmente se marcan con radioisótopos, biotina, epítopos o fluoróforos. Las sondas de ADN marcadas con biotina se pueden detectar con fosfatasa alcalina marcada con estreptavidina mediante varios métodos enzimáticos y químicos.
Figura 01: Sonda de ADN
Se conoce la secuencia de nucleótidos de la sonda de ADN. Son secuencias cortas con una longitud de 100 a 1000 pares de bases. Las sondas largas de ADN pueden generarse mediante tecnología de ADN recombinante. También se pueden generar por PCR y clonación. En los laboratorios de microbiología clínica, las sondas de ADN están fácilmente disponibles para el diagnóstico rápido de enfermedades infecciosas.
¿Qué son las sondas de ARN?
Las sondas de ARN son tramos monocatenarios de ARN. Son secuencias complementarias a las secuencias diana de la muestra. Por lo general, se sintetizan con las ARN polimerasas de los bacteriófagos SP6, T7 o T3 mediante la transcripción in vitro de ADN. Pueden generarse sondas de ARN largas mediante transcripción in vitro a partir de ADN de plásmido linealizado. En general, las sondas de ARN se unen con más fuerza y más fuerza a sus secuencias complementarias que las sondas de ADN. Al igual que las sondas de ADN, las sondas de ARN también se pueden marcar mientras se transcriben.
¿Cuáles son las similitudes entre las sondas de ADN y ARN?
- Tanto las sondas de ADN como las de ARN son secuencias de nucleótidos monocatenarias.
- Ambos están diseñados y sintetizados artificialmente.
- Además, se pueden marcar con radioisótopos, epítopos, biotina o fluoróforos.
- Tienen una fuerte afinidad hacia una secuencia diana específica de ADN o ARN.
- Se utilizan en diversas técnicas de transferencia e hibridación in situ para la detección de secuencias de ácidos nucleicos diana.
- Ambos tipos de sondas se pueden hibridar con sus secuencias complementarias.
- También se utilizan en la identificación de microorganismos y el diagnóstico de enfermedades infecciosas, hereditarias y de otro tipo.
¿Cuál es la diferencia entre las sondas de ADN y ARN?
La sonda de ADN es un tramo corto de ADN que es complementario a la secuencia diana. Por otro lado, la sonda de ARN es un tramo corto de cadena sencilla de ARN complementario a la secuencia diana. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre las sondas de ADN y ARN. Además, las sondas de ADN contienen A, T, C y G, mientras que las sondas de ARN contienen A, U, C y G.
Además, otra diferencia entre las sondas de ADN y ARN es su estabilidad termodinámica. Las sondas de ARN muestran una mayor estabilidad termodinámica en comparación con las sondas de ADN.
La siguiente infografía tabula las diferencias importantes entre las sondas de ADN y ARN.
Resumen: sondas de ADN frente a ARN
Una sonda es un pequeño fragmento de ADN o ARN que se utiliza para detectar la presencia de una secuencia específica en la muestra de ADN o ARN mediante hibridación molecular. Las sondas de ADN son fragmentos cortos de ADN monocatenario, mientras que las sondas de ARN son secuencias cortas de ARN monocatenario. Son secuencias conocidas. La estabilidad termodinámica es mayor en las sondas de ARN que en las de ADN. Las sondas de ARN se unen más estrechamente a sus secuencias complementarias que las sondas de ADN. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre las sondas de ADN y ARN.
