La diferencia clave entre la secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo es que, en la secuenciación aleatoria jerárquica, el genoma se divide en fragmentos más grandes antes de la secuenciación, mientras que en la secuenciación aleatoria del genoma completo, todo el genoma se divide en pequeños fragmentos para la secuenciación.
La secuenciación es una técnica importante en los procesos moleculares, especialmente en la identificación precisa de especies. De hecho, es la técnica de identificar el orden preciso de los nucleótidos en un gen o un genoma. Hay muchas técnicas para la secuenciación. Algunos de estos incluyen el Método Maxam Gilbert, el Método Sanger y el método Sanger automatizado.
¿Qué es la secuencia de escopeta jerárquica?
La secuenciación de escopeta jerárquica es un método de secuenciación. También se denomina "secuenciación de arriba hacia abajo". Además, este método consta de dos pasos: el primer paso es la amplificación del genoma y el segundo paso es la fragmentación del genoma. En este método, primero se corta el genoma en fragmentos grandes. Le sigue la clonación de estos grandes fragmentos en varios huéspedes utilizando vectores o cromosomas artificiales. Luego, estos vectores recombinantes se organizan en una biblioteca. Durante la secuenciación aleatoria, los clones del vector recombinante se secuencian individualmente. Los fragmentos de los clones se someten a una digestión de restricción para reducir aún más el tamaño del genoma, por lo que se someten a secuenciación.
Figura 01: Secuenciación de escopeta jerárquica
Durante la secuenciación de escopeta jerárquica, los fragmentos grandes deben organizarse en orden, antes de la secuenciación de escopeta. Tiene lugar con la ayuda de los marcadores moleculares que se incorporan durante el proceso de clonación.
La secuenciación aleatoria jerárquica crea un mapa genético de baja resolución. Pero crea un mapa de secuencia ordenado. Por lo tanto, toma una duración más larga que la secuenciación directa. Todo el proceso se retrasa debido a la creación de una biblioteca de vectores recombinantes. ¿Es también una técnica intensiva en mano de obra? Sin embargo, en la actualidad, la técnica está automatizada para facilitar el trabajo.
¿Qué es la secuenciación aleatoria del genoma completo?
La secuenciación aleatoria del genoma completo es un proceso de secuenciación de un solo paso. En este proceso, primero se produce el corte del genoma completo. A continuación, cada uno de estos pequeños fragmentos se secuencia aleatoriamente. Una vez completada la secuenciación, tiene lugar el análisis de secuencias. Durante el análisis de secuencias, las secuencias superpuestas se eliminan y el análisis no es un proceso ordenado. Por lo tanto, el ensamblaje de secuencias es un proceso menos eficiente en comparación con la secuenciación aleatoria jerárquica. Sin embargo, el proceso de secuenciación rápida del genoma completo es más rápido y el análisis del genoma completo puede realizarse en una sola instancia.
¿Cuáles son las similitudes entre la secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo?
- La secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo son dos enfoques de secuenciación.
- Ambos se someten a secuenciación de Sanger o métodos de secuenciación de Sanger automatizados.
- Participan en la secuenciación de fragmentos de ADN y ARN.
- Además, ambos métodos son importantes en el diagnóstico molecular y fines de investigación.
- Actualmente, ambas técnicas están automatizadas o basadas en computadora.
- Ambas técnicas se basan en la fragmentación del genoma.
¿Cuál es la diferencia entre la secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo?
La secuenciación de escopeta jerárquica genera fragmentos de mayor tamaño en comparación con la secuenciación de escopeta del genoma completo, que funciona con pequeños fragmentos de secuencias. Entonces, esta es la diferencia clave entre la secuenciación de escopeta jerárquica y del genoma completo. Además, la secuenciación de escopeta jerárquica consta de dos pasos principales, mientras que la secuenciación de escopeta de todo el genoma se basa en un paso principal.
Además, otra diferencia entre la secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo es que la resolución es mayor en la secuenciación aleatoria del genoma completo en comparación con la secuenciación aleatoria jerárquica.
La siguiente infografía resume la diferencia entre la secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo.
Resumen: secuenciación jerárquica frente a secuenciación de escopeta del genoma completo
La secuenciación aleatoria jerárquica y del genoma completo son dos técnicas para secuenciar genomas grandes. La secuencia de escopeta jerárquica es un proceso de secuenciación de dos pasos en el que el genoma se divide en fragmentos más grandes. Por el contrario, la secuenciación aleatoria del genoma completo es una secuenciación de un solo paso en la que el genoma se divide en pequeños fragmentos y se secuencia directamente. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre la secuenciación de escopeta jerárquica y del genoma completo. Además, los aspectos técnicos pueden variar entre las dos técnicas.
