La diferencia clave entre el empalme cis y trans es que el empalme cis es un mecanismo intramolecular que elimina intrones y une los exones que están dentro de la misma transcripción de ARN, mientras que el empalme trans es un mecanismo intermolecular que elimina intrones o outrones y une los exones que no están dentro de la misma transcripción de ARN.
El empalme de ARN es una forma de procesamiento de ARN antes de la síntesis de proteínas. En este proceso, una transcripción de ARN pre-mensajero recién hecha se transforma en un ARN mensajero maduro. El ARN mensajero maduro ayuda a producir una molécula de proteína. Durante el empalme del ARN, los intrones (regiones no codificantes) se eliminan y los exones (regiones codificantes) se unen para formar ARNm maduro. El empalme cis y trans son dos tipos de mecanismos de empalme de ARN.
¿Qué es el empalme Cis?
El empalme Cis es un mecanismo intramolecular que elimina intrones y une los exones que se encuentran dentro de la misma transcripción de ARN. El empalme cis normal procesa una sola molécula de ARN. El empalme cis es el proceso de empalme típico de premRNA llevado a cabo por spliceosomas. En el intrón, un sitio donante (extremo 5' del intrón), un sitio de ramificación (cerca del extremo 3' del intrón) y un sitio aceptor (extremo 3' del intrón) son muy esenciales para el empalme. El sitio donante de empalme incluye una secuencia invariable GU en el extremo 5' del intrón. El sitio aceptor de corte y empalme en el extremo 3' del intrón tiene una secuencia AG invariable. Aguas arriba de la secuencia AG, hay una región llamada región de pirimidina (tracto de polipirimidina). Más arriba del tramo de polipirimidina, hay un punto de ramificación que incluye un nucleótido de adenosina. Este nucleótido está involucrado en la formación de lazo.
Figura 01: Empalme cis y trans
Los principales espliceosomas son U1, U2, U4, U5 y U6. Entre ellos, U1 y U2 son muy importantes. En el empalme cis, U1 se une al sitio de empalme 5' y U2 se une al punto de ramificación cerca del sitio de empalme 3'. U5/U4/U6 se une a los exones en el sitio 5', con U6 uniéndose a U2. Más tarde, se lanza U1. U5 cambia de exón a intrón y U6 se une en el sitio de empalme 5'. Además, también se lanza U4. U6/U2 cataliza la transesterificación, haciendo que el extremo 5' del intrón se una al nucleótido A del intrón. Esto desencadena la formación de lazo. En la formación de un lariat, U5 se une al exón en el sitio de empalme 3' y se escinde el sitio 5'. En la fase final del empalme, U2/U5/U6 permanecen unidos al lazo y se corta el sitio 3'. Además de eso, los exones se ligan usando hidrólisis de ATP en esta fase.
¿Qué es el empalme trans?
El empalme trans es un mecanismo intermolecular que elimina intrones o outrones y une los exones que no están dentro de la misma transcripción de ARN. En el empalme trans, no hay un sitio de empalme 5' en la molécula de ARNm pre para que se una la proteína U1. En su lugar, el ARN líder de empalme con tapa (SL) se transempalma para secuenciar en el outron.
Figura 02: Empalme trans
Outron es una región del ARNm pre entre la tapa 5' y el sitio de empalme trans. Sin embargo, la proteína U2 generalmente se une al sitio de empalme 3 '. Después de eliminar el outron, el exón líder de empalme (SL) se empalma con el primer exón en el premRNA. Además, el empalme trans es un mecanismo que se observa en ciertos microorganismos como los protistas de la clase Kinetoplastae para expresar genes.
¿Cuáles son las similitudes entre el empalme cis y trans?
- El empalme cis y trans son dos tipos de mecanismos de empalme de ARN.
- En ambos mecanismos, se eliminan los intrones.
- Además, en ambos mecanismos, los exones se unen para formar ARNm maduro.
- Ambos mecanismos se encuentran en eucariotas.
- Estos mecanismos están ausentes en los procariotas.
¿Cuál es la diferencia entre el empalme cis y trans?
El empalme cis es un mecanismo intramolecular que elimina intrones y une los exones que están dentro del mismo transcrito de ARN, mientras que el empalme trans es un mecanismo intermolecular que elimina intrones o outrones y une los exones que no están dentro del mismo ARN transcripción. Entonces, esta es la diferencia clave entre el empalme cis y trans. Además, en el empalme cis, los intrones se eliminan para formar ARNm maduro. Por otro lado, en el corte y empalme trans, los intrones o los outrones se eliminan para formar ARNm maduro.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre el empalme cis y trans en forma tabular para una comparación lado a lado.
Resumen: Cis vs Trans Splicing
El empalme de ARN es una forma de procesamiento de ARN antes del proceso de síntesis de proteínas. El empalme cis y trans son dos tipos de mecanismos de empalme de ARN que se encuentran en eucariotas. El empalme cis es un mecanismo intramolecular que elimina intrones y une los exones que están dentro de la misma transcripción de ARN, mientras que el empalme trans es un mecanismo intermolecular que elimina intrones o outrones y une los exones que no están dentro de la misma transcripción de ARN. Por lo tanto, esto concluye la discusión de la diferencia entre empalme cis y trans.
